Você não se preocupou em especificar se está usando um flash externo ou não, um flash ou controle remoto montado na câmera e qual tipo de flash.
Você mencionou "O Flash estava no ETTL". Isso conta para um flash externo. O que é muito ruim, pois tenho uma explicação melhor para um flash interno (queda de tensão), mas pode ser esticado para corresponder ao externo.
A estabilização da imagem é feita pela lente. Para isso, ele precisa de informações da câmera e corrente da câmera. A corrente é usada para suspender e mover os elementos de estabilização da imagem em um campo magnético.
Agora, o que acontece é que, no momento de disparar o flash, algo muda significativamente para o IS. A comunicação é interrompida devido ao pulso eletromagnético de uma descarga rápida ou à tensão / corrente disponível para trabalhar a estabilização da imagem cai porque o circuito de recarga do flash começa a consumir grande corrente. Corrente adicional é absorvida pela abertura da lente, fechando seu valor nominal: isso também pode causar algum distúrbio mecânico, para que você possa tentar fazer alguma diferença ao fotografar na abertura máxima.
Verifique também a velocidade do obturador tomada: geralmente deve ser apenas a velocidade de sincronização do flash e da câmera.
Por isso, tente: abertura máxima (reduz a ação da abertura, mas também a potência do flash, para que não seja um teste completamente isolado), baterias novas ou use a fonte de alimentação principal, verifique novamente os contatos da lente para ficarem limpos (em caso de dúvida, limpe-os com um pouco de álcool em um cotonete pode ser uma idéia) e a lente deve ser montada e travada bem. Tente usar o flash externo em vez do flash interno e vice-versa ou um flash externo diferente.
Você encontrou uma solução alternativa, mas seria bom descobrir qual é o problema exato para poder reconhecê-lo quando surgir em circunstâncias um pouco diferentes.