O Lightroom não faz alterações no arquivo original. Ele armazena as ações de cada edição no catálogo LR. Quando você exporta uma imagem para, digamos, um JPEG, o LR executa cada uma dessas ações, criando um novo arquivo, neste caso, um JPEG. Nunca altera o original. O arquivo RAW não é realmente uma imagem, mas dados gravados pelo sensor. Você vê uma imagem na visualização porque o arquivo RAW realmente armazena uma pequena imagem de visualização JPEG no arquivo. Portanto, 'cortar' o RAW não é significativo. Em vez disso, você usa os dados RAW para criar uma imagem que pode ser cortada como saída final. A saída pode ser JPEG, TIFF, PSD, DNG, etc.
O local do catálogo pode ser encontrado em Configurações do catálogo.
Você também pode solicitar ao Lightroom para armazenar essas mesmas ações de edição em um arquivo 'sidecar', que será armazenado ao lado (no mesmo diretório) da sua imagem RAW, selecionando "Escrever automaticamente alterações no XMP" na guia Metadados das configurações do catálogo .