Se você tiver apenas o código php em um arquivo html, mas vários outros arquivos que contenham apenas o código html, você pode adicionar o seguinte ao seu arquivo .htaccess para que ele sirva apenas esse arquivo específico como php.
<Files yourpage.html>
AddType application/x-httpd-php .html
//you may need to use x-httpd-php5 if you are using php 5 or higher
</Files>
Isso tornará o PHP executável SOMENTE no arquivo "yourpage.html" e não em todas as suas páginas html, o que evitará a lentidão em todo o servidor.
Quanto ao motivo de alguém querer servir php através de um arquivo html, eu uso a função IMPORTHTML em planilhas do Google para importar dados JSON de um url externo que deve ser analisado com php para limpá-lo e construir uma tabela html. Até agora, não encontrei nenhuma maneira de importar um arquivo .php para as planilhas do Google, então ele deve ser salvo como um arquivo .html para que a função funcione. Ser capaz de servir php através de um arquivo .html é necessário para esse uso específico.