Outra coisa que você pode tentar se estiver com problemas de codificação para 'utf-8' e quiser ir célula por célula, tente o seguinte.
Python 2
(Onde "df" é seu objeto DataFrame.)
for column in df.columns:
for idx in df[column].index:
x = df.get_value(idx,column)
try:
x = unicode(x.encode('utf-8','ignore'),errors ='ignore') if type(x) == unicode else unicode(str(x),errors='ignore')
df.set_value(idx,column,x)
except Exception:
print 'encoding error: {0} {1}'.format(idx,column)
df.set_value(idx,column,'')
continue
Então tente:
df.to_csv(file_name)
Você pode verificar a codificação das colunas:
for column in df.columns:
print '{0} {1}'.format(str(type(df[column][0])),str(column))
Aviso: erros = 'ignorar' apenas omitirá o caracter, por exemplo
IN: unicode('Regenexx\xae',errors='ignore')
OUT: u'Regenexx'
Python 3
for column in df.columns:
for idx in df[column].index:
x = df.get_value(idx,column)
try:
x = x if type(x) == str else str(x).encode('utf-8','ignore').decode('utf-8','ignore')
df.set_value(idx,column,x)
except Exception:
print('encoding error: {0} {1}'.format(idx,column))
df.set_value(idx,column,'')
continue
index=False
para soltar o índice.