EDITAR: Embora esta resposta esteja marcada como a resposta correta (em 2013), atualmente, conforme respondido por @ user2511630 abaixo, você pode arrastar e soltar arquivos apk diretamente no emulador para instalá-los.
Resposta Original:
Você pode instalar arquivos .apk no emulador, independentemente do que estiver usando (Eclipse ou Android Studio)
aqui está o que eu sempre faço: (para iniciantes)
1- Execute o emulador e aguarde até que seja completamente iniciado.
2- Vá para a pasta de instalação do SDK e, em seguida, vá para ferramentas de plataforma (você deve ver um executável chamado adb.exe )
3- crie um novo arquivo e chame-o de run.bat , edite o arquivo com o bloco de notas e escreva CMD nele e salve-o.
4- copie seu apk desejado para a mesma pasta
5- agora abra run.bat e escreva adb install "your_apk_file.apk"
6- aguarde até que a instalação seja concluída
7 - voila seu apk está instalado em seu emulador.
Nota: para reinstalar o aplicativo caso já exista useadb install -r "your_apk_file.apk"
desculpe pelas instruções detalhadas como eu disse para iniciantes
Espero essa ajuda.
Saudações,
Tarek