Eu tenho um script que lê os dados de um arquivo CSV em um data.table
e divide o texto em uma coluna em várias colunas novas. Atualmente, estou usando as funções lapply
e strsplit
para fazer isso. Aqui está um exemplo:
library("data.table")
df = data.table(PREFIX = c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"),
VALUE = 1:6)
dt = as.data.table(df)
# split PREFIX into new columns
dt$PX = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 1))
dt$PY = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 2))
dt
# PREFIX VALUE PX PY
# 1: A_B 1 A B
# 2: A_C 2 A C
# 3: A_D 3 A D
# 4: B_A 4 B A
# 5: B_C 5 B C
# 6: B_D 6 B D
No exemplo acima, a coluna PREFIX
é dividida em duas novas colunas PX
e PY
no caractere "_".
Mesmo que isso funcione bem, eu queria saber se existe uma maneira melhor (mais eficiente) de fazer isso usando data.table
. Meus conjuntos de dados reais têm> = 10M + linhas, então a eficiência de tempo / memória torna-se muito importante.
ATUALIZAR:
Seguindo a sugestão de @Frank, criei um caso de teste maior e usei os comandos sugeridos, mas o stringr::str_split_fixed
método demora muito mais do que o original.
library("data.table")
library("stringr")
system.time ({
df = data.table(PREFIX = rep(c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"), 1000000),
VALUE = rep(1:6, 1000000))
dt = data.table(df)
})
# user system elapsed
# 0.682 0.075 0.758
system.time({ dt[, c("PX","PY") := data.table(str_split_fixed(PREFIX,"_",2))] })
# user system elapsed
# 738.283 3.103 741.674
rm(dt)
system.time ( {
df = data.table(PREFIX = rep(c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"), 1000000),
VALUE = rep(1:6, 1000000) )
dt = as.data.table(df)
})
# user system elapsed
# 0.123 0.000 0.123
# split PREFIX into new columns
system.time ({
dt$PX = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 1))
dt$PY = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 2))
})
# user system elapsed
# 33.185 0.000 33.191
Portanto, o str_split_fixed
método leva cerca de 20 vezes mais.
stringr
pacote, este é o comando:str_split_fixed(PREFIX,"_",2)
. Não estou respondendo porque não testei a aceleração ... Ou, em uma etapa:dt[,c("PX","PY"):=data.table(str_split_fixed(PREFIX,"_",2))]