Reordenar barras em geom_bar ggplot2


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Estou tentando fazer um gráfico de barras onde o gráfico é ordenado do miRNAmais alto valueao mais miRNAbaixo. Por que meu código não funciona?

> head(corr.m)

        miRNA         variable value
1    mmu-miR-532-3p      pos     7
2    mmu-miR-1983        pos    75
3    mmu-miR-301a-3p     pos    70
4    mmu-miR-96-5p       pos     5
5    mmu-miR-139-5p      pos    10
6    mmu-miR-5097        pos    47

ggplot(corr.m, aes(x=reorder(miRNA, value), y=value, fill=variable)) + 
  geom_bar(stat="identity")

Respostas:


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Seu código funciona bem, exceto que o gráfico de barras é ordenado de baixo para cima. Quando você quiser ordenar as barras de cima para baixo, você terá que adicionar um -sinal antes value:

ggplot(corr.m, aes(x = reorder(miRNA, -value), y = value, fill = variable)) + 
  geom_bar(stat = "identity")

que dá:

insira a descrição da imagem aqui


Dados usados:

corr.m <- structure(list(miRNA = structure(c(5L, 2L, 3L, 6L, 1L, 4L), .Label = c("mmu-miR-139-5p", "mmu-miR-1983", "mmu-miR-301a-3p", "mmu-miR-5097", "mmu-miR-532-3p", "mmu-miR-96-5p"), class = "factor"),
                         variable = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L), .Label = "pos", class = "factor"),
                         value = c(7L, 75L, 70L, 5L, 10L, 47L)),
                    class = "data.frame", row.names = c("1", "2", "3", "4", "5", "6"))

por algum motivo, ele não é solicitado em meu gráfico
user3741035

@ user3741035 Estranho. Você o usou no conjunto de dados de amostra fornecido acima ou em todo o conjunto de dados?
Jaap

Qual versão do R & ggplot você está usando? Você também pode privilegiar um conjunto de dados de amostra maior (de preferência com mais de um valor para variable)?
Jaap

6
encontrei a solução: carreguei a biblioteca (gplots) que bagunçou as coisas
user3741035

1
@maycca Ele está me dando o resultado correto (em ambos OSX 10.10.4 / Windows 7, R 3.2.3 e ggplot2 2.1.0). Talvez você deva começar com uma nova sessão?
Jaap
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