Existe algum comando para encontrar o erro padrão da média em R?
Respostas:
O erro padrão é apenas o desvio padrão dividido pela raiz quadrada do tamanho da amostra. Assim, você pode facilmente fazer sua própria função:
> std <- function(x) sd(x)/sqrt(length(x))
> std(c(1,2,3,4))
[1] 0.6454972
O erro padrão (SE) é apenas o desvio padrão da distribuição de amostragem. A variância da distribuição amostral é a variância dos dados dividida por N e SE é a raiz quadrada disso. Partindo desse entendimento, percebe-se que é mais eficiente usar a variância no cálculo da SE. A sd
função em R já faz uma raiz quadrada (o código para sd
está em R e é revelado digitando apenas "sd"). Portanto, o seguinte é mais eficiente.
se <- function(x) sqrt(var(x)/length(x))
para tornar a função um pouco mais complexa e lidar com todas as opções que você poderia passar var
, você poderia fazer esta modificação.
se <- function(x, ...) sqrt(var(x, ...)/length(x))
Usando essa sintaxe, pode-se tirar vantagem de coisas como a forma como var
lida com valores ausentes. Qualquer coisa que possa ser passada var
como um argumento nomeado pode ser usada nesta se
chamada.
stderr
é um nome de função em base
.
stderr
NÃO calcula o erro padrão que exibedisplay aspects. of connection
stderr
calcula o erro padrão, ele estava avisando que este nome é usado no base, e John originalmente nomeou sua função stderr
(verifique o histórico de edição ...).
Uma versão da resposta de John acima que remove os incômodos NAs:
stderr <- function(x, na.rm=FALSE) {
if (na.rm) x <- na.omit(x)
sqrt(var(x)/length(x))
}
stderr
no base
pacote que faz outra coisa, então pode ser melhor escolher outro nome para esta, por exemplose
O pacote sciplot tem a função embutida se (x)
Como estou voltando a esta pergunta de vez em quando e porque ela é antiga, estou postando um benchmark para as respostas mais votadas.
Observe que para as respostas de @Ian e @John, criei outra versão. Em vez de usar length(x)
, usei sum(!is.na(x))
(para evitar NAs). Usei um vetor de 10 ^ 6, com 1.000 repetições.
library(microbenchmark)
set.seed(123)
myVec <- rnorm(10^6)
IanStd <- function(x) sd(x)/sqrt(length(x))
JohnSe <- function(x) sqrt(var(x)/length(x))
IanStdisNA <- function(x) sd(x)/sqrt(sum(!is.na(x)))
JohnSeisNA <- function(x) sqrt(var(x)/sum(!is.na(x)))
AranStderr <- function(x, na.rm=FALSE) {
if (na.rm) x <- na.omit(x)
sqrt(var(x)/length(x))
}
mbm <- microbenchmark(
"plotrix" = {plotrix::std.error(myVec)},
"IanStd" = {IanStd(myVec)},
"JohnSe" = {JohnSe(myVec)},
"IanStdisNA" = {IanStdisNA(myVec)},
"JohnSeisNA" = {JohnSeisNA(myVec)},
"AranStderr" = {AranStderr(myVec)},
times = 1000)
mbm
Resultados:
Unit: milliseconds
expr min lq mean median uq max neval cld
plotrix 10.3033 10.89360 13.869947 11.36050 15.89165 125.8733 1000 c
IanStd 4.3132 4.41730 4.618690 4.47425 4.63185 8.4388 1000 a
JohnSe 4.3324 4.41875 4.640725 4.48330 4.64935 9.4435 1000 a
IanStdisNA 8.4976 8.99980 11.278352 9.34315 12.62075 120.8937 1000 b
JohnSeisNA 8.5138 8.96600 11.127796 9.35725 12.63630 118.4796 1000 b
AranStderr 4.3324 4.41995 4.634949 4.47440 4.62620 14.3511 1000 a
library(ggplot2)
autoplot(mbm)
Você pode usar a função stat.desc do pacote pastec.
library(pastec)
stat.desc(x, BASIC =TRUE, NORMAL =TRUE)
você pode encontrar mais sobre isso aqui: https://www.rdocumentation.org/packages/pastecs/versions/1.3.21/topics/stat.desc
Lembrando que a média também pode ser obtida por meio de um modelo linear, regredindo a variável contra uma única interceptação, você também pode usar a lm(x~1)
função para isso!
As vantagens são:
confint()
car::linear.hypothesis()
sandwich
## generate data
x <- rnorm(1000)
## estimate reg
reg <- lm(x~1)
coef(summary(reg))[,"Std. Error"]
#> [1] 0.03237811
## conpare with simple formula
all.equal(sd(x)/sqrt(length(x)),
coef(summary(reg))[,"Std. Error"])
#> [1] TRUE
## extract confidence interval
confint(reg)
#> 2.5 % 97.5 %
#> (Intercept) -0.06457031 0.0625035
Criado em 2020-10-06 pelo pacote reprex (v0.3.0)
y <- mean(x, na.rm=TRUE)
sd(y)
para desvio padrão var(y)
para variância.
Ambas as derivações usam n-1
o denominador, portanto, são baseadas em dados de amostra.