Respostas:
No Visual Studio 2015/2017/2019:
Para VS2013 v4 + e VS2015
Clique em "Configurações" (no menu inicial do projeto ou no menu suspenso superior) e selecione "Configurações do Git". Você verá uma configuração global de "Local do repositório padrão" (o que você deseja). Altere-o e clique em Atualizar.
Além das configurações Git do Team Explorer ...
... provavelmente você desejará alterar o local padrão do projeto:
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