Aqui está um antes e um depois de uma das minhas telas depois de atualizar para o Xcode 8.
Tudo o que fiz foi abrir meu main.storyboard e, a partir daí, construir e executar meu aplicativo no meu telefone.
No meu controle de versão, posso ver que o Xcode está fazendo muitas alterações no meu main.storyboard apenas depois de abri-lo.
Sempre que excluo essas alterações, posso ver o que uso para ver no Xcode 7.3.1.
Mas, assim que eu reabrir o construtor de interface com meu storyboard, vejo essas mudanças voltando ao lugar.
Posso fazer algo aqui?
Antes do Xcode 8
Após a atualização para o Xcode 8
Debug View Hierarchy
. Outros objetos da mesma classe que estão em UICollectionViews não são os afetados.