Eu gosto de combinar o esquema escuro do editor com o esquema escuro IPython. Quanto ao IPython, vá para
Tools > Preferences > IPython cosole > display tab
e verifique Dark background
.
Reinicie o kernel. Em seguida, observe as cores que você obtém, digamos, ao importar. Meu spyder2 (python 2.7) usa ipython 5.3.0 do Anaconda e a importação é rosa, o melhor esquema de correspondência para o editor é o Monokai, você escolhe isso em
Tools > Preferences > Syntax coloring
Meu spyder3, ao escolher o fundo escuro IPython (2.4.1) imprime cores um pouco diferentes do Monokai, mas se você for para
Tools > Preferences > Syntax coloring
você vai para a Monokai
guia e ajusta um pouco as cores. Tive que mudar o integrado de lilás para ciano