ATUALIZAÇÃO EM 17 DE JULHO DE 2018:
Mesmo que a solução a seguir ainda funcione até hoje, descobri (graças à resposta postada por Hamid Asghari e ao comentário postado por Mahendra Dabi) que simplesmente deletar o diretório dist gradle e reiniciar o ide consertará o problema (leia a postagem de Hamid para obter uma resposta completa e lembre-se de que OSX e Linux têm o mesmo caminho do gradle).
Se você ainda deseja seguir minha solução original, deve pelo menos considerar o uso de uma versão mais atualizada do Gradle (link direto do repositório de distribuição do gradle: https://services.gradle.org/distributions/ )
Resposta original (datada de 7 de março de 2017):
Eu enfrentei o mesmo problema esta manhã depois de atualizar o Android Studio para 2.3. Para resolver o problema:
1) Baixe manualmente o binário Gradle 3.3 (link direto: https://services.gradle.org/distributions/gradle-3.3-bin.zip )
2) Abra o diretório raiz do Android Studio e extraia o zip para a pasta gradle (por exemplo, em minha máquina Debian, o caminho completo é /opt/android-studio/gradle/gradle-3.3)
3) Abra o Android Studio, vá para Arquivo-> Configurações-> Build, Exectution, Deployment-> Gradle e defina "Gradle home" para apontar sua nova pasta gradle-3.3.
4) Sincronize e você está pronto para começar!