Atualizei recentemente para o Xcode 4 (que é uma ótima atualização), mas agora estou recebendo alguns avisos que não recebi antes. Eu procurei em fóruns e outras postagens de SO, mas não encontrei como corrigir isso.
Os avisos que recebo são avisos no nível do projeto para um arquivo ausente. Os arquivos que estão sendo mostrados foram excluídos da visualização do navegador do projeto (também escolhendo excluir do sistema de arquivos). No entanto, ainda parece estar aparecendo como de alguma forma vinculado ao projeto, mesmo que o arquivo não apareça mais no navegador do projeto.
Eu olhei em volta e não encontrei como posso dizer ao Xcode que esses arquivos sumiram, pare de me dar avisos. Aqui está uma captura de tela que recebo no Xcode4, mas nunca no Xcode 3.