matplotlib / seaborn: primeira e última linha cortadas pela metade do mapa de calor

Ao plotar mapas de calor com animais do mar (e matrizes de correlação com matplotlib), a primeira e a última linha são cortadas pela metade. Isso também acontece quando executo este exemplo de código mínimo que encontrei online.

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

Os rótulos no eixo y estão no local correto, mas as linhas não estão completamente lá.

Há alguns dias, funcionou como planejado. Desde então, instalei o texlive-xetex, então o removi novamente, mas não resolveu meu problema.

Alguma ideia do que eu poderia estar perdendo?

Infelizmente, matplotlib 3.1.1 quebrou mapas de calor marítimos ; e em geral eixos invertidos com marcas fixas.
Isso foi corrigido na versão de desenvolvimento atual; você pode daqui

• reverter para matplotlib 3.1.0
• use matplotlib 3.1.2 ou superior
• definir os limites do mapa de calor manualmente ( ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top)

É um bug na regressão matplotlib entre 3.1.0 e 3.1.1. Você pode corrigir isso:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Corrigido usando o acima e definindo os limites do mapa de calor manualmente.

Primeiro

ax = sns.heatmap(...

verificado os eixos atuais com

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

Corrigido com

ax.set_ylim(6.0, 0)

Resolvi isso adicionando esta linha em meu código, com matplotlib==3.1.1:

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NB. A única razão pela qual isso funciona é porque o eixo x não foi alterado, então use por sua própria conta e risco com futuras versões mpl

matplotlib 3.1.2 está disponível - Está disponível na nuvem Anaconda via conda-forge, mas não consegui instalá-lo via conda install. A alternativa manual funcionou: baixe matplotlib 3.1.2 do github e instale via pip

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Acontece com matplotlib versão 3.1.1, conforme sugerido pela importância de seringernest

Seguir resolveu meu problema

pip install matplotlib==3.1.0

rustyDev está certo sobre o conda-forge, mas eu não precisei fazer uma instalação pip manual a partir de um download do github. Para mim, no Windows, funcionou diretamente. E as tramas são boas novamente.

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

pontos opcionais, não necessários para a resposta:

Depois, tentei outras etapas, mas não são necessárias: No prompt do conda: conda search matplotlib --info não mostrou nenhuma informação de nova versão, a informação mais recente foi para 3.1.1. Portanto, tentei pip usando pip install matplotlib==3.1.2But pip diz "Requisito já satisfeito"

Então obter a versão de acordo com medium.com/@rakshithvasudev/… python - import matplotlib - matplotlib.__version__mostra que 3.1.2 foi instalado com sucesso

A propósito, eu tive esse erro diretamente após atualizar o Spyder para v4.0.0. O erro estava em um gráfico de uma matriz de confusão. Isso já foi mencionado há alguns meses. stackoverflow.com/questions/57225685/… que já está relacionado a esta questão marítima.

conda install matplotlib = 3.1.0

Isso funcionou para mim e baixei o matplotlib de 3.1.1 para 3.1.0 e os mapas de calor começaram a se comportar corretamente

Resolvi esse problema com o seguinte código: