Acabei de montar o que você pode estar procurando: http://www.graphdracula.net
É JavaScript com layout de gráfico direcionado, SVG e você pode até arrastar os nós. Ainda precisa de alguns ajustes, mas é totalmente utilizável. Você cria nós e arestas facilmente com o código JavaScript como este:
var g = new Graph();
g.addEdge("strawberry", "cherry");
g.addEdge("cherry", "apple");
g.addEdge("id34", "cherry");
Eu usei a biblioteca Raphael JS mencionada anteriormente (o exemplo do graffle) mais algum código para um algoritmo de layout gráfico baseado em força que encontrei na rede (tudo de código aberto, licença MIT). Se você tiver algum comentário ou precisar de um determinado recurso, eu posso implementá-lo, basta perguntar!
Você também pode dar uma olhada em outros projetos! Abaixo estão duas meta-comparações:
O SocialCompare possui uma extensa lista de bibliotecas, e a linha "Gráfico de nós / arestas" filtrará as de visualização de gráficos.
O DataVisualization.ch avaliou muitas bibliotecas, incluindo as de nó / gráfico. Infelizmente, não há link direto, então você terá que filtrar por "gráfico":
Aqui está uma lista de projetos semelhantes (alguns já foram mencionados aqui):
Bibliotecas Pure JavaScript
O vis.js suporta muitos tipos de gráficos de rede / borda, além de linhas de tempo e gráficos 2D / 3D. Layout automático, agrupamento automático, mecanismo físico dinâmico, otimizado para celular, navegação por teclado, layout hierárquico, animação etc. MIT licenciado e desenvolvido por uma empresa holandesa especializada em pesquisa em redes auto-organizadas.
Cytoscape.js - análise gráfica interativa e visualização com suporte móvel, seguindo as convenções jQuery. Financiado por meio de subsídios do NIH e desenvolvido por @maxkfranz (veja sua resposta abaixo ) com a ajuda de várias universidades e outras organizações.
O JavaScript InfoVis Toolkit - Jit, uma estrutura de desenho e layout de gráfico multifuncional interativa. Veja, por exemplo, a Árvore Hiperbólica . Construído pelo arquiteto de dataviz do Twitter Nicolas Garcia Belmonte e comprado pela Sencha em 2010.
D3.js Poderosa biblioteca de visualização JS multiuso, sucessora do Protovis. Veja o exemplo de gráfico direcionado à força e outros exemplos de gráficos na galeria .
A biblioteca de visualização JS de Plotly usa D3.js com ligações JS, Python, R e MATLAB. Veja um exemplo nexworkx no IPython aqui , exemplo de interação humana aqui e API JS Embed .
sigma.js Biblioteca leve mas poderosa para desenhar gráficos
Plug-in jsPlumb jQuery para criar gráficos conectados interativos
Springy - um algoritmo de layout de gráfico direcionado à força
Processing.js porta Javascript da biblioteca de processamento por John Resig
JS Graph It - arraste e cole caixas conectadas por linhas retas. Layout automático mínimo das linhas.
RaphaelJS's Graffle - exemplo gráfico interativo de uma biblioteca genérica de desenho vetorial de múltiplos propósitos. O RaphaelJS não pode fazer o layout dos nós automaticamente; você precisará de outra biblioteca para isso.
JointJS Core - biblioteca de diagramação de código aberto licenciado por MPL de David Durman. Ele pode ser usado para criar diagramas estáticos ou ferramentas de diagramação totalmente interativas e construtores de aplicativos. Funciona em navegadores compatíveis com SVG. Algoritmos de layout não incluídos no pacote principal
mxGraph Biblioteca de diagramações HTML 5 anteriormente comercial, agora disponível no Apache v2.0. mxGraph é a biblioteca de base utilizada no draw.io .
Bibliotecas comerciais
Bibliotecas abandonadas
Visualizador de rede JS incorporável do Cytoscape Web (nenhum novo recurso planejado; sucedido pelo Cytoscape.js)
Canviz JS processador para gráficos GraphViz. Abandonado em setembro de 2013.
arbor.js Gráficos sofisticados com física agradável e colírio para os olhos. Abandonado em maio de 2012. Existem vários garfos semi-mantidos .
jssvggraph "O algoritmo de layout de gráfico direcionado por força mais simples possível implementado como uma biblioteca Javascript que usa objetos SVG". Abandonado em 2012.
jsdot Aplicativo de desenho gráfico do lado do cliente. Abandonado em 2011 .
Kit de ferramentas gráficas Protovis para visualização (JavaScript). Substituído por d3.
Moo Wheel Interactive JS representação para conexões e relações (2008)
Script de visualização de gráfico da era de 2007 da JSViz
dagre Layout gráfico para JavaScript
Bibliotecas não Javascript
Linguagem sofisticada de visualização de gráficos
Flare Desenho gráfico bonito e poderoso baseado em Flash
Visualização de gráfico Python do NodeBox