Gráfico de dispersão Matplotlib; cor em função de uma terceira variável


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Eu quero fazer um gráfico de dispersão (usando matplotlib) em que os pontos sejam sombreados de acordo com uma terceira variável. Eu tenho muito perto disso:

plt.scatter(w, M, c=p, marker='s')

onde we M são os pontos de dados ep é a variável que eu quero sombrear em relação a.
No entanto, quero fazê-lo em escala de cinza em vez de em cores. Alguém pode ajudar?

Respostas:


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Não há necessidade de definir manualmente as cores. Em vez disso, especifique um mapa de cores em escala de cinza ...

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

# Generate data...
x = np.random.random(10)
y = np.random.random(10)

# Plot...
plt.scatter(x, y, c=y, s=500)
plt.gray()

plt.show()

insira a descrição da imagem aqui

Ou, se você preferir uma gama mais ampla de mapas de cores , também pode especificar o cmapkwarg para scatter. Para usar a versão reversa de qualquer um deles, basta especificar a " _r" versão de qualquer um deles. Por exemplo, em gray_rvez de gray. Existem vários mapas de cores diferentes tons de cinza pré-fabricados (por exemplo gray, gist_yarg, binary, etc.).

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# Generate data...
x = np.random.random(10)
y = np.random.random(10)

plt.scatter(x, y, c=y, s=500, cmap='gray')
plt.show()

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Obrigado! Existe alguma maneira de desenhar contornos em torno desses pontos contendo uma certa quantidade do peso total?
Thomas Collett

6
mpl.cmtambém está disponível diretamente como plt.cm.
heltonbiker

@Thomas Collet: Se você quiser desenhar contornos, você tem que interpolar os dados formam os pontos a uma matriz 2D, então traçar que o uso plt.contour()ou plt.contourf()- mas isso é uma questão diferente
Zak

Como você pode adicionar o rótulo na legenda? Nesse caso, com números contínuos, suspeito que você usaria a barra de cores. E no caso de valores discretos? por exemplo, eu poderia adicionar três marcadores na legenda para minhas três categorias?
Nate

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No matplotlib, as cores cinza podem ser fornecidas como uma sequência de um valor numérico entre 0-1.
Por exemploc = '0.1'

Depois, você pode converter sua terceira variável em um valor dentro desse intervalo e usá-la para colorir seus pontos.
No exemplo a seguir, usei a posição y do ponto como o valor que determina a cor:

from matplotlib import pyplot as plt

x = [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9]
y = [125, 32, 54, 253, 67, 87, 233, 56, 67]

color = [str(item/255.) for item in y]

plt.scatter(x, y, s=500, c=color)

plt.show()

insira a descrição da imagem aqui


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Para o registro, você pode aplicar ALPHA como um mapa de cores se você fornecer uma matriz em forma de (n, 4) como cargumento, com valores alfa na quarta coluna. Se a terceira variável for Z, com shape=(n,1), então colors = numpy.hstack((numpy.zeros_like(z), numpy.zeros_like(z), numpy.ones_like(z), z/z.max()))produz um efeito muito agradável (é claro que pode ser ajustado).
Heltonbiker # 13/13

Eu recebo um erro: 'o comprimento da sequência rgba deve ser 3 ou 4'
MattCochrane 4/15

1
@MattClimbs Suspeito que você esteja chamando plt.plot em vez de plt.scatter, como no exemplo.
Smashbro

como você adiciona uma barra de cores a esse gráfico?
FaCoffee

2
@FaCoffee plt.colorbar()vai fazer isso
Mathew Savage

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Às vezes, pode ser necessário plotar cores com precisão, com base no caso de valor x . Por exemplo, você pode ter um quadro de dados com 3 tipos de variáveis ​​e alguns pontos de dados. E você quer fazer o seguinte,

  • Plotar pontos correspondentes à variável física 'A' em RED.
  • Plotar pontos correspondentes à variável física 'B' em AZUL.
  • Plotar pontos correspondentes à variável física 'C' em VERDE.

Nesse caso, pode ser necessário gravar na função abreviada para mapear os valores x para os nomes de cores correspondentes como uma lista e depois passar essa lista para o plt.scattercomando.

x=['A','B','B','C','A','B']
y=[15,30,25,18,22,13]

# Function to map the colors as a list from the input list of x variables
def pltcolor(lst):
    cols=[]
    for l in lst:
        if l=='A':
            cols.append('red')
        elif l=='B':
            cols.append('blue')
        else:
            cols.append('green')
    return cols
# Create the colors list using the function above
cols=pltcolor(x)

plt.scatter(x=x,y=y,s=500,c=cols) #Pass on the list created by the function here
plt.grid(True)
plt.show()

Gráfico de dispersão para colorir em função da variável x


como criar uma barra de cores para esse gráfico?
Maryam Rahmani Moghaddam
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