ele faz parecer um pouco complicado para ignorar arquivos (e pastas) no Team Foundation Server. Encontrei algumas maneiras de fazer isso (usando o TFS / Team Explorer / Visual Studio 2008). Esses métodos também funcionam com o tipo de projeto ASP do site.
Uma maneira é adicionar um item novo ou existente a um projeto (por exemplo, clique com o botão direito do mouse no projeto, Adicionar item existente ou arraste e solte do Windows Explorer para o Solution Explorer), deixe o TFS processar o (s) arquivo (s) ou pasta (s) e, em seguida, desfazer a pendência alterações nos itens. O TFS irá desmarcá-los como tendo uma alteração de adição pendente, e os arquivos ficarão quietos no projeto e ficarão fora do TFS.
Outra maneira é com o comando Adicionar itens à pasta do Source Control Explorer. Isso inicia um pequeno assistente e, em uma das etapas, você pode selecionar itens a serem excluídos (embora eu ache que seja necessário adicionar pelo menos um item ao TFS com esse método para que o assistente continue).
Você pode até adicionar uma política de check-in de padrões proibidos (em Equipe -> Configurações do projeto de equipe -> Controle de origem ... -> Política de check-in) para impedir que outras pessoas na equipe façam check-in por engano em determinados ativos.