Como direito, você pode comprar um Raspberry Pi e usá-lo para qualquer finalidade pretendida que desejar.
No entanto, o principal problema que você pode encontrar é o nível de disponibilidade. Os RPi são dispositivos pequenos e quentes, com disponibilidade limitada. A demanda certamente esfriará em um futuro próximo, mas mesmo em relação a um período de tempo mais longo (um ano ou dois), a capacidade de produção pode não ser ampla o suficiente para atender pedidos de maior quantidade (mais de 1000) para aplicações comerciais.
A longo prazo, isso pode ser uma possibilidade, mas, no futuro previsível, o RPi pode não ser a melhor escolha para um sistema de computador comercial incorporado, a menos que você espere integrar o dispositivo em um número muito pequeno de unidades e esteja disposto a esperar um muito tempo para receber seu próprio inventário.
Somente você conhece suas necessidades específicas e pode justificar o uso do dispositivo.
ATUALIZAR
Ontem (16 de julho de 2012), o blog oficial do Raspberry Pi divulgou informações informando que a produção das placas RPi está sendo significativamente aumentada e que os pedidos de compra devem ser preenchidos dentro de 4 a 6 semanas e os pedidos em massa do dispositivo agora podem ser colocou.
Obviamente, se você precisar de um número excessivamente grande de unidades (ou seja, milhares), receber seus Pis pode levar mais tempo do que as 4-6 semanas previstas. Além disso, o Gizmodo informou que a produção aumentou para 4.000 unidades por dia. Acredito que, na maioria dos casos, essa quantidade de produção atenda à demanda da maioria dos projetos de pequeno e médio porte.