Como criar um domínio 3D aleatório representando a estrutura de raiz de uma planta?


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Gostaria de modelar o fluxo laminar de água das raízes ao caule de uma planta. No final das raízes, os tubos variam de milímetro a centímetro de diâmetro e comprimento. À medida que nos aproximamos do caule, as raízes aumentam em comprimento e diâmetro. Quero criar domínios aleatórios em 3D que representem a rede de raízes com diâmetros e comprimentos variados. Qual seria a melhor maneira de criar essa geometria.


Este é um objeto estático ou você deseja crescimento dinâmico durante uma simulação?
shuhalo

Respostas:


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As chances são de que você não queira algo verdadeiramente aleatório; você deseja algo que tenha a mesma estrutura 3D abstrata de um sistema radicular da planta, mas além de um certo nível de abstração, não se importa com a aparência do sistema radicular. Eu suponho que você queira alguma maneira de gerar domínios fractal 3D do tipo mencionado neste artigo, descrevendo o cálculo das dimensões fractal dos sistemas radiculares .

Depois de puxar este artigo sobre a análise fractal da eficiência da exploração do solo por sistemas radiculares , encontrei o pacote SimRoot que parece gerar geometrias 3D de sistemas radiculares que podem lhe interessar. Infelizmente, eles esquecem de fornecer uma maneira de baixar o pacote. No entanto, o site deles vincula-se a outros pacotes que modelam sistemas raiz, como o PlantGL do INRIA, que é de código aberto.

Obviamente, depois de criar a geometria, você precisará descobrir como extrair os dados relevantes em um formato compatível e usá-los nas simulações do PDE. Deixo essa parte com você.


Eu procurei e não parece que o SimRoot esteja disponível / publicado gratuitamente para download. Você encontrou um link que sugere o contrário?
Aron Ahmadia 03/04

Aparentemente, eles não têm um link para download publicado, mas há outro software disponível no INRIA que está disponível gratuitamente. Acho que os desenvolvedores do SimRoot não querem que outras pessoas usem seus softwares.
perfil completo de Geoff Oxberry


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Eu acho que a resposta de Geoff Oxberry é muito boa. Ele fornece soluções prontas para uso.

Se você quiser ir por conta própria:

  • Os sistemas L mencionados podem gerar estruturas semelhantes a raízes se você fornecer as regras corretas. existe este livro sobre "A beleza algorítmica das plantas" , mas não cobre os sistemas radiculares.

  • Os processos de agregação limitada por difusão também podem gerar estruturas semelhantes a raízes. Se você agrega esferas e, uma vez agregado, produz a união booleana da estrutura, o volume será mesclado diretamente (suavização necessária, quase com certeza).

Como eu disse, não há muitas soluções, mas talvez as idéias o ajudem. Se você implementar algo, não se esqueça de liberá-lo com uma licença grátis! : D


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Algo que pode ser útil para você é o seguinte artigo:

Olga Wildeotter: "Um método numérico adaptativo para a equação de Richards com crescimento radicular", Plant and Soil, 2003

Eles tratam apenas um modelo 2D e usam um autômato celular para simular o crescimento. No entanto, ele não está diretamente relacionado à sua pergunta.

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