Quais são as implementações mais rápidas disponíveis do BLAS / LAPACK ou outras rotinas de álgebra linear em sistemas de GPU?


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A nVidia, por exemplo, possui CUBLAS, que promete aceleração de 7-14x. Ingenuamente, isso não chega nem perto do rendimento teórico de qualquer placa de GPU da nVidia. Quais são os desafios para acelerar a álgebra linear em GPUs, e já existem roteiros mais rápidos de álgebra linear disponíveis?

Respostas:


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Não consigo responder a segunda metade da sua pergunta em relação a outras implementações existentes, mas posso fornecer algumas dicas sobre os desafios. Para referência, eu pessoalmente usei o ViennaCL em uma nVidia GTX 560 Ti com 2 GB de memória para meus benchmarks.

Sobre o código de série em um i5 de gama média, vi acelerações para multiplicações densas de matriz de aproximadamente 40x. Para operações como uma multiplicação vetorial escalar, vi velocidades de 1000x. O gorila de 800 libras na sala, no entanto, é a largura de banda da memória. Para a maioria das GPUs comerciais, você usará algo como PCIe, que limita a cerca de 6 GB / s de taxa de transferência. No meu caso, enquanto o cálculo era 40x mais rápido, as três cópias matriciais (duas para a GPU e uma para trás) demoravam tanto tempo quanto a computação na CPU.

O problema, então, com qualquer biblioteca geral de álgebra linear da GPU, é que eles não podem realmente reutilizar objetos na GPU, porque não sabem o que você fará com eles. Portanto, toda chamada para um kernel de computação provavelmente precisará copiar para a GPU e, em seguida, copiar o resultado novamente. Isso consumirá grande parte dos ganhos.

Se você puder reutilizar objetos como matrizes, poderá escrever algoritmos de nível superior para evitar o máximo de gerenciamento de memória possível, mas seria difícil pressionar uma biblioteca para fazer isso com eficiência.

Espero que isso ajude, e tenho certeza de que há outras pessoas aqui com muito mais experiência nisso, mas essas são as experiências e impressões que recebi durante minha curta incursão na computação em GPU.


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É por isso que você deseja que os objetos que ficam na GPU por um longo período de tempo, em vez de serem copiados ansiosamente de volta para a CPU. Por exemplo, matrizes e vetores PETSc contêm um sinalizador indicando se a CPU e / ou GPU está atual. Uma operação na GPU marca a versão da CPU como suja e vice-versa. Uma cópia é feita de forma transparente se você solicitar a memória em um local sujo, mas isso é raro se todos os componentes algorítmicos que tocam as grandes estruturas de dados puderem ser executados no mesmo local.
Jed Brown

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Deixe-me focar apenas em CUDA e BLAS.

A aceleração em uma implementação de BLAS do host não é uma boa métrica para avaliar a taxa de transferência, pois depende de muitos fatores, embora eu concorde que a aceleração geralmente é o que importa.

Se você olhar para os benchmarks publicados pela NVIDIA e levar em consideração que o Tesla M2090 tem desempenho máximo de 1331 Gigaflops (precisão única) e 665 Gigaflops (duplo prec.), Verá que, para o SGEMM e o DGEMM, temos uma taxa de transferência medida quase em 60% do teórico, o que é muito bom.

2mnkm×kk×n

No que diz respeito à taxa de transferência sustentada de ponto flutuante, acho que os flops devem ser calculados sem levar em consideração os tempos de transferência de dados e resultados, e isso dificulta as comparações de aceleração. Além disso, você deve levar em consideração o tamanho da matriz, pois o melhor desempenho é para matrizes grandes.

Conclusão: a aceleração de um aplicativo da vida real pode ser muito diferente do desempenho medido em pico nas rotinas de álgebra linear, pois é necessário levar em consideração a inicialização da GPU, os tempos de transferência de dados, etc.

Portanto, não responderei sua pergunta sobre a biblioteca mais rápida, pois a pergunta não faz sentido, a menos que uma métrica e um problema precisos sejam definidos. Tudo isso dito, acho que cuBLAS e MAGMA são um bom ponto de partida.

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