Só para adicionar um pouco ao consenso de que o EBS é mais rápido ...
Um ponto importante a ser entendido aqui é que a velocidade de armazenamento da instância é imprevisível - a Amazon não garante isso.
Essas informações são do livro Cloud Application Architectures, de George Reese (que parece muito bom com o que eu revelei até agora). Ele inclui uma tabela intitulada Comparação das opções de armazenamento de dados do EC2 (p. 41); Aqui está um trecho dessa tabela (no livro, existem várias outras características comparadas):
S3 Instance EBS
Speed Low Unpredictable High
Reliability Medium High High
Durability Super high Super low High
Portanto, às vezes, o armazenamento da instância pode superar o EBS no acesso de leitura, mas se você deseja alta velocidade constante , é necessário acompanhá-lo. Como Reese coloca em seu livro:
Outra questão é a imprevisibilidade do desempenho no armazenamento da instância. Você pode realmente pensar que deve ser mais rápido que as outras opções, e às vezes é. Às vezes, no entanto, é incrivelmente lento - mais lento que um NFS montado sobre uma conexão Ethernet de 10bT. O EBS, por outro lado, fornece consistentemente o desempenho de uma SAN através de uma conexão Ethernet de GB.