Se você possui um kernel e uma versão recentes recentes do iptables, pode usar o alvo TRACE (parece estar embutido no mínimo no Debian 5.0). Você deve definir as condições do seu rastreio para serem o mais específicas possível e desabilitar quaisquer regras de TRACE quando não estiver depurando, pois elas enviam muitas informações aos logs.
TRACE
Este alvo marca os pacotes para que o kernel registre todas as regras que correspondem aos pacotes à medida que atravessam as tabelas, cadeias, regras. (O módulo ipt_LOG ou ip6t_LOG é necessário para o log.) Os pacotes são registrados com o prefixo da sequência: "TRACE: tablename: chainname: type: rulenum" onde o tipo pode ser "regra" para regra simples, "return" para regra implícita no final de uma cadeia definida pelo usuário e "política" para a política das cadeias incorporadas. Só pode ser usado na tabela bruta.
Se você adicionou regras como esta
iptables -t raw -A PREROUTING -p tcp --destination 192.168.0.0/24 --dport 80 -j TRACE
iptables -t raw -A OUTPUT -p tcp --destination 192.168.0.0/24 --dport 80 -j TRACE
Você receberá uma saída parecida com esta.
# cat /var/log/kern.log | grep 'TRACE:'
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325658] TRACE: raw:PREROUTING:policy:2 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.12.152 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=80 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325689] TRACE: mangle:PREROUTING:policy:1 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.12.152 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=80 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325713] TRACE: nat:PREROUTING:rule:1 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.12.152 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=80 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: nat:nat.1:rule:1 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.12.152 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=80 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: mangle:INPUT:policy:1 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: filter:INPUT:rule:2 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: filter:in_world:rule:1 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: filter:in_world_all_c1:return:2 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: filter:in_world:rule:2 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)
Mar 24 22:41:52 enterprise kernel: [885386.325731] TRACE: filter:in_world_irc_c2:return:2 IN=eth0 OUT= MAC=00:1d:7d:aa:e3:4e:00:04:4b:05:b4:dc:08:00 SRC=192.168.32.18 DST=192.168.32.10 LEN=52 TOS=0x00 PREC=0x00 TTL=128 ID=30561 DF PROTO=TCP SPT=53054 DPT=3128 SEQ=3653700382 ACK=0 WINDOW=8192 RES=0x00 SYN URGP=0 OPT (020405B40103030201010402)