Respostas:
Você deve poder usar setup.exe
sem a GUI:
setup.exe -q -n -N -d -R c:\cygwin -s http://yourFavoriteMirror \
-l c:\localPackageDir -P <comma-separated list of packages to install>
Isto é da lista de e- mail cygwin (e post de acompanhamento)
Esta pergunta já foi feita aqui . Responda:
wget http://apt-cyg.googlecode.com/svn/trunk/apt-cyg
chmod +x apt-cyg
mv apt-cyg /usr/local/bin/
apt-cyg install bc