A principal vantagem disso é que ele permite um controle de acesso mais flexível: se um usuário possui direitos de root via sudo, é fácil conceder direitos de root ou removê-los conforme necessário. Por outro lado, se você realmente entrega às pessoas o root pw, você não pode tirá-lo (a menos que seja o Men In Black ;-)), você só pode mudar o root pw, o que afetará a todos.
Nesse contexto, logins raiz diretos são desnecessários porque ninguém tem a raiz pw.
(Você ainda precisará do pw raiz para acesso de emergência no console no modo de usuário único; mas deve haver disposições especiais para isso).