O Windows é um pouco famoso por ter um e apenas um sistema de arquivos, NTFS. Também não consegui descobrir nada que sugira que o NTFS tenha soma de verificação. O mais próximo que cheguei é de um documento que descreve a soma de verificação que protege os blocos GPT em um disco dinâmico. O documento "Novidades em 2008" não mostra nada parecido com o NTFS ( link ).
EXT4 usa soma de verificação de diário, mas não soma de verificação de dados.
O GPFS também faz soma de verificação de diário.
A idéia é nova o suficiente, ainda não está em muitos sistemas de arquivos. O Btrfs ainda é 'experimental' no Linux, e o ext4 saiu recentemente desse estado.