Respostas:
Encontrei a resposta no Blog de Raphael Hertzog :
apt-get install -o Dpkg::Options::="--force-confold" --force-yes -y mysql-server
É função do dpkg configurar, portanto, escolher qual arquivo conf manter.
Nos sistemas ubuntu atuais, você precisa de um pouco mais:
export DEBIAN_FRONTEND=noninteractive ; apt-get dist-upgrade -y -o Dpkg::Options::="--force-confdef" -o Dpkg::Options::="--force-confold" --force-yes
--force-yes
deve ser usado como último recurso, pois tem a oportunidade de quebrar seu sistema! Por favor, visite esta página de gerenciamento para obter detalhes sobre o uso das opções --allow .