Respostas:
Depende de como você deseja sincronizar os dados. Deseja fazer isso automaticamente e apenas fazer com que o banco de dados B seja uma cópia de A? Ou, se A e B tiverem algumas linhas com a mesma chave primária interna, mas diferentes outras informações, qual banco de dados você deseja que seja o 'mestre'? Esta pergunta precisa de muito mais detalhes fornecidos. Leia também em http://aws.amazon.com/rds/mysql/#Multi-AZ - que pode responder a algumas de suas perguntas.