O tipo de partição não é importante para lvm, md ou mount. Todos eles estão verificando assinaturas e estruturas internas para determinar se podem usar o dispositivo. Somente programas de particionamento amigáveis podem ficar confusos. Você pode alterar com segurança o tipo de partição, se desejar estar correto.
Eu acho que é melhor não usar o rótulo do disco do MS-DOS (tabela de partição), se o disco é o segundo disco do sistema e você pretende usar o LVM. Você pode usar a etiqueta do disco LVM diretamente no disco. Para arquitetura x86 e x64, você precisa usar partições do MS-DOS (ou GPT para sistemas UEFI) para o disco de inicialização, mas o restante pode ter o rótulo do disco LVM diretamente no disco não-licenciado.