Você não pode transferir uma instância do EC2 (ou qualquer outro recurso) para uma conta diferente da AWS.
Se a instância for a inicialização do EBS (recomendável), você pode tentar uma abordagem como esta:
Pare a instância atual (instâncias de interrupção ec2)
Crie uma AMI a partir da instância (ec2-register-image)
Conceda à segunda conta da AWS permissão para executar essa AMI (ec2-modify-image-attribute)
Execute uma nova instância da AMI na segunda conta da AWS (ec2-run-instances)
O DNS precisaria ser atualizado para apontar para o endereço IP da nova instância (de preferência usando um endereço IP elástico). Quaisquer outros recursos da AWS / EC2 também precisam ser copiados / recriados na segunda conta.
Após testes suficientes, convém liberar a instância original (instâncias de terminação ec2).
A segunda conta deve criar seus próprios snapshots / AMIs da instância para se protegerem se o volume da instância / EBS falhar após a exclusão da AMI de sua propriedade.
Melhor ainda, você deve ter documentado / script exatamente como sua instância foi criada para que o cliente possa reproduzir isso à vontade.