Se você deseja apenas um site e precisa alterar o caminho da pasta para esse site, edite as configurações básicas no site, alterando o caminho físico para a pasta do outro site.
Se você quer dizer que já adicionou um site completamente novo no IIS, precisará editar as ligações em seus sites.
Para a Web, convém editar as ligações http no site rotulado Site padrão e no outro site desejado. Clique com o botão direito do mouse no site e escolha Editar Ligações ... ou selecione o site e clique em Ligações ... no painel Ações.
A maneira mais rápida é excluir o site rotulado Site padrão, mas isso pode não ser o desejado.
A próxima maneira mais rápida é alterar as ligações no site padrão para uma porta diferente de 80. Em seguida, defina a porta no site desejado como 80 e deixe o campo Nome do host em branco nas ligações http.
Se você deseja ter os dois sites em execução e vinculados à porta 80, nas ligações no Site Padrão, coloque algo na caixa Nome do host na ligação http. Deixe em branco no site desejado. Mantenha ambos na porta 80 (ou altere o site padrão para outra porta). Agora, isso deve permitir que o site desejado seja usado quando alguém usa http://localhost
ou um URL com o nome do host do seu servidor.
EDIT:
Na sua edição - sim, sua terminologia estava um pouco fora :)
Para configurar um aplicativo como padrão, para que, quando alguém acessar a raiz do seu site, o aplicativo seja exibido, você precisará configurar um redirecionamento de algum tipo.
Aqui estão algumas maneiras de fazer isso:
- Adicione um redirecionamento HTTP ao nível raiz do seu site. Clique em Site padrão na árvore de navegação e redirecione HTTP. Você precisará decidir por si mesmo como configurar o redirecionamento com base nas suas necessidades para o aplicativo. Isso pode ter efeitos remanescentes se você decidir desfazer isso no futuro, dependendo do código de status definido.
- Adicione uma página padrão na raiz do seu site com um redirecionamento (por qualquer plataforma de programação que você queira - HTHML / JavaScript, ASP [.NET], etc). Isso provavelmente é mais fácil e rápido e não terá necessariamente um efeito prolongado.