alta média de carga, alta espera, mensagens de erro de ataque dmesg (servidor debian nfs)


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Debian 6 no HP proliant (2 CPU) com ataque (2 * 1.5T RAID1 + 2 * 2T RAID1 se juntou ao RAID0 para criar 3.5T) rodando principalmente nfs & imapd (mais samba para compartilhamento de janelas e www local para visualizar páginas da web); com o cliente de desktop ubuntu local montando $ HOME, laptops acessando imap e arquivos ímpares (por exemplo, vídeos) via nfs / smb; caixas conectadas 100baseT ou wifi via roteador / switch doméstico

uname -a

Linux prole 2.6.32-5-686 #1 SMP Wed Jan 11 12:29:30 UTC 2012 i686 GNU/Linux

A instalação está funcionando há meses, mas é propensa a ficar intermitentemente muito lenta (experiência do usuário na montagem de desktop $ HOME a partir do servidor ou laptop executando vídeos) e agora consistentemente tão ruim que tive que me aprofundar nela para tentar descobrir o que havia de errado (! )

O servidor parece bom com carga baixa, por exemplo, cliente (laptop) (com $ HOME no disco local) conectando-se ao imapd e ao nfs de montagem RAID do servidor para acessar 1 arquivo: o topo mostra carga ~ 0,1 ou menos, 0 espera

mas quando o cliente (desktop) monta $ HOME e inicia a sessão do usuário KDE (todos os servidores acessando), o topo é exibido, por exemplo

top - 13:41:17 up  3:43,  3 users,  load average: 9.29, 9.55, 8.27
Tasks: 158 total,   1 running, 157 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
Cpu(s):  0.4%us,  0.4%sy,  0.0%ni, 49.0%id, 49.7%wa,  0.0%hi,  0.5%si,  0.0%st
Mem:    903856k total,   851784k used,    52072k free,   171152k buffers
Swap:        0k total,        0k used,        0k free,   476896k cached

  PID USER      PR  NI  VIRT  RES  SHR S %CPU %MEM    TIME+  COMMAND                                                                                                     
 3935 root      20   0  2456 1088  784 R    2  0.1   0:00.02 top                                                                                                         
    1 root      20   0  2028  680  584 S    0  0.1   0:01.14 init                                                                                                        
    2 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kthreadd                                                                                                    
    3 root      RT   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 migration/0                                                                                                 
    4 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.12 ksoftirqd/0                                                                                                 
    5 root      RT   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 watchdog/0                                                                                                  
    6 root      RT   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 migration/1                                                                                                 
    7 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.16 ksoftirqd/1                                                                                                 
    8 root      RT   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 watchdog/1                                                                                                  
    9 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.42 events/0                                                                                                    
   10 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:02.26 events/1                                                                                                    
   11 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 cpuset                                                                                                      
   12 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 khelper                                                                                                     
   13 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 netns                                                                                                       
   14 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 async/mgr                                                                                                   
   15 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 pm                                                                                                          
   16 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.02 sync_supers                                                                                                 
   17 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.02 bdi-default                                                                                                 
   18 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kintegrityd/0                                                                                               
   19 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kintegrityd/1                                                                                               
   20 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.02 kblockd/0                                                                                                   
   21 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.08 kblockd/1                                                                                                   
   22 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kacpid                                                                                                      
   23 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kacpi_notify                                                                                                
   24 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kacpi_hotplug                                                                                               
   25 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 kseriod                                                                                                     
   28 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:04.19 kondemand/0                                                                                                 
   29 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:02.93 kondemand/1                                                                                                 
   30 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 khungtaskd                                                                                                  
   31 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.18 kswapd0                                                                                                     
   32 root      25   5     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 ksmd                                                                                                        
   33 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 aio/0                                                                                                       
   34 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 aio/1                                                                                                       
   35 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 crypto/0                                                                                                    
   36 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 crypto/1                                                                                                    
  203 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 ksuspend_usbd                                                                                               
  204 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 khubd                                                                                                       
  205 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 ata/0                                                                                                       
  206 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.00 ata/1                                                                                                       
  207 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.14 ata_aux                                                                                                     
  208 root      20   0     0    0    0 S    0  0.0   0:00.01 scsi_eh_0  

O dmesg sugere que há um problema no disco:

.............. (previous episode)
[13276.966004] raid1:md0: read error corrected (8 sectors at 489900360 on sdc7)
[13276.966043] raid1: sdb7: redirecting sector 489898312 to another mirror

[13279.569186] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0
[13279.569211] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13279.569230] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13279.569257] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13279.569262]          res 41/40:00:05:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13279.569306] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13279.569321] ata4.00: error: { UNC }
[13279.575362] ata4.00: configured for UDMA/133
[13279.575388] ata4: EH complete
[13283.169224] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0
[13283.169246] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13283.169263] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13283.169289] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13283.169294]          res 41/40:00:07:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13283.169331] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13283.169345] ata4.00: error: { UNC }
[13283.176071] ata4.00: configured for UDMA/133
[13283.176104] ata4: EH complete
[13286.224814] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0
[13286.224837] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13286.224853] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13286.224879] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13286.224884]          res 41/40:00:06:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13286.224922] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13286.224935] ata4.00: error: { UNC }
[13286.231277] ata4.00: configured for UDMA/133
[13286.231303] ata4: EH complete
[13288.802623] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0
[13288.802646] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13288.802662] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13288.802688] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13288.802693]          res 41/40:00:05:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13288.802731] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13288.802745] ata4.00: error: { UNC }
[13288.808901] ata4.00: configured for UDMA/133
[13288.808927] ata4: EH complete
[13291.380430] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0
[13291.380453] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13291.380470] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13291.380496] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13291.380501]          res 41/40:00:05:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13291.380577] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13291.380594] ata4.00: error: { UNC }
[13291.386517] ata4.00: configured for UDMA/133
[13291.386543] ata4: EH complete
[13294.347147] ata4.00: exception Emask 0x0 SAct 0x1 SErr 0x0 action 0x0

[13294.347169] ata4.00: irq_stat 0x40000008
[13294.347186] ata4.00: failed command: READ FPDMA QUEUED
[13294.347211] ata4.00: cmd 60/08:00:00:6a:05/00:00:23:00:00/40 tag 0 ncq 4096 in
[13294.347217]          res 41/40:00:06:6a:05/00:00:23:00:00/40 Emask 0x409 (media error) <F>
[13294.347254] ata4.00: status: { DRDY ERR }
[13294.347268] ata4.00: error: { UNC }
[13294.353556] ata4.00: configured for UDMA/133
[13294.353583] sd 3:0:0:0: [sdc] Unhandled sense code
[13294.353590] sd 3:0:0:0: [sdc] Result: hostbyte=DID_OK driverbyte=DRIVER_SENSE
[13294.353599] sd 3:0:0:0: [sdc] Sense Key : Medium Error [current] [descriptor]
[13294.353610] Descriptor sense data with sense descriptors (in hex):
[13294.353616]         72 03 11 04 00 00 00 0c 00 0a 80 00 00 00 00 00 
[13294.353635]         23 05 6a 06 
[13294.353644] sd 3:0:0:0: [sdc] Add. Sense: Unrecovered read error - auto reallocate failed
[13294.353657] sd 3:0:0:0: [sdc] CDB: Read(10): 28 00 23 05 6a 00 00 00 08 00
[13294.353675] end_request: I/O error, dev sdc, sector 587557382
[13294.353726] ata4: EH complete
[13294.366953] raid1:md0: read error corrected (8 sectors at 489900544 on sdc7)
[13294.366992] raid1: sdc7: redirecting sector 489898496 to another mirror

e eles estão acontecendo com bastante frequência, o que eu acho que pode explicar o problema de desempenho (?)

# dmesg | espelho grep

[12433.561822] raid1: sdc7: redirecting sector 489900464 to another mirror
[12449.428933] raid1: sdb7: redirecting sector 489900504 to another mirror
[12464.807016] raid1: sdb7: redirecting sector 489900512 to another mirror
[12480.196222] raid1: sdb7: redirecting sector 489900520 to another mirror
[12495.585413] raid1: sdb7: redirecting sector 489900528 to another mirror
[12510.974424] raid1: sdb7: redirecting sector 489900536 to another mirror
[12526.374933] raid1: sdb7: redirecting sector 489900544 to another mirror
[12542.619938] raid1: sdc7: redirecting sector 489900608 to another mirror
[12559.431328] raid1: sdc7: redirecting sector 489900616 to another mirror
[12576.553866] raid1: sdc7: redirecting sector 489900624 to another mirror
[12592.065265] raid1: sdc7: redirecting sector 489900632 to another mirror
[12607.621121] raid1: sdc7: redirecting sector 489900640 to another mirror
[12623.165856] raid1: sdc7: redirecting sector 489900648 to another mirror
[12638.699474] raid1: sdc7: redirecting sector 489900656 to another mirror
[12655.610881] raid1: sdc7: redirecting sector 489900664 to another mirror
[12672.255617] raid1: sdc7: redirecting sector 489900672 to another mirror
[12672.288746] raid1: sdc7: redirecting sector 489900680 to another mirror
[12672.332376] raid1: sdc7: redirecting sector 489900688 to another mirror
[12672.362935] raid1: sdc7: redirecting sector 489900696 to another mirror
[12674.201177] raid1: sdc7: redirecting sector 489900704 to another mirror
[12698.045050] raid1: sdc7: redirecting sector 489900712 to another mirror
[12698.089309] raid1: sdc7: redirecting sector 489900720 to another mirror
[12698.111999] raid1: sdc7: redirecting sector 489900728 to another mirror
[12698.134006] raid1: sdc7: redirecting sector 489900736 to another mirror
[12719.034376] raid1: sdc7: redirecting sector 489900744 to another mirror
[12734.545775] raid1: sdc7: redirecting sector 489900752 to another mirror
[12734.590014] raid1: sdc7: redirecting sector 489900760 to another mirror
[12734.624050] raid1: sdc7: redirecting sector 489900768 to another mirror
[12734.647308] raid1: sdc7: redirecting sector 489900776 to another mirror
[12734.664657] raid1: sdc7: redirecting sector 489900784 to another mirror
[12734.710642] raid1: sdc7: redirecting sector 489900792 to another mirror
[12734.721919] raid1: sdc7: redirecting sector 489900800 to another mirror
[12734.744732] raid1: sdc7: redirecting sector 489900808 to another mirror
[12734.779330] raid1: sdc7: redirecting sector 489900816 to another mirror
[12782.604564] raid1: sdb7: redirecting sector 1242934216 to another mirror
[12798.264153] raid1: sdc7: redirecting sector 1242935080 to another mirror
[13245.832193] raid1: sdb7: redirecting sector 489898296 to another mirror
[13261.376929] raid1: sdb7: redirecting sector 489898304 to another mirror
[13276.966043] raid1: sdb7: redirecting sector 489898312 to another mirror
[13294.366992] raid1: sdc7: redirecting sector 489898496 to another mirror

embora as matrizes ainda estejam em execução em todos os discos - elas ainda não desistiram de:

# cat / proc / mdstat

Personalities : [raid1] [raid0] 
md10 : active raid0 md0[0] md1[1]
      3368770048 blocks super 1.2 512k chunks

md1 : active raid1 sde2[2] sdd2[1]
      1464087824 blocks super 1.2 [2/2] [UU]

md0 : active raid1 sdb7[0] sdc7[2]
      1904684920 blocks super 1.2 [2/2] [UU]

unused devices: <none>

Então, eu acho que tenho alguma idéia do que é o problema, mas não sou um especialista em sysadmin do linux pelo mais remoto limite da imaginação e gostaria muito de ver algumas pistas aqui com meu diagnóstico e o que preciso fazer:

  1. obviamente eu preciso adquirir outra unidade para sdc. (Suponho que eu poderia comprar uma unidade maior se o preço for justo: estou pensando que um dia precisarei aumentar o tamanho da matriz e isso seria uma unidade a menos para substituir por uma maior)
  2. use o mdadm para reprovar o sdc existente, remova-o e ajuste a nova unidade
  3. fdisk a nova unidade com a mesma partição de tamanho para a matriz que a antiga
  4. use mdadm para adicionar a nova unidade na matriz

isso soa bem?


1
Sim, seu plano está no local.
mgorven

2
Estou vendo erros no sdb e sdc acima em seus logs. O melhor é executar (agora e regularmente) testes SMART em seus discos. Nas minhas próprias matrizes e discos, geralmente executo verificações semanais 'smartctl -t long' em todos os discos. Erros e discos com falha podem ser encontrados rapidamente.
Sig-IO

1) Obtenha uma nova unidade, particione-a de acordo 2) mdadm --add / dev / mdX / dev / sdX1 3) Espere
Sig-IO

1
iotop pode ajudá-lo também no futuro: apt-get install iotop.
grs

3
Presumo que seu plano tenha funcionado conforme o esperado. Você poderia responder à sua própria pergunta com um breve relatório para ajudar outros leitores que possam encontrar a sua postagem?
Dmitri Chubarov

Respostas:


1

Geralmente, quando há um erro no disco, como você está vendo, o disco tende a fazer uma pausa por um momento para tentar corrigir o erro em si, e o RAID do Linux tolerará que algum disco aguarde até que a marca fique ruim. Essa pausa no disco pode ser o que está causando as lentidões (especialmente na taxa de erros que você está vendo).

Seu plano para substituir a unidade está correto. No entanto, eu não recomendaria obter um driver maior com a noção de parte de particionamento para o RAID de substituição e, em seguida, parte para uso de outra coisa posteriormente. Seria mais sensato ficar mais perto do disco original (tamanho e velocidade) para manter a matriz consistente. Dito isto, você poderia, em teoria, aumentar e particionar o tamanho exato de substituição para a substituição da matriz e, em seguida, outra partição para outra coisa (mesmo outro membro de uma matriz).

Uma observação lateral que pode ajudar na depuração: Uma ferramenta que eu gosto de usar como um substituto para o topo é chamada no topo ( http://www.atoptool.nl/ ) e pode fornecer mais visualização de cada disco e processos usando o disco I / O e onde está o gargalo (você pode observar que a E / S de espera é para o disco específico que está com o problema).

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