O grande benefício do ESX sobre o ESXi é que, com o ESX, você pode usar o Virtual Center para gerenciar tudo em um único local (o Virtual Center é um custo adicional único).
Se você estiver usando o armazenamento da SAN, poderá usar o Virtual Center para criar um cluster ESX que moverá os convidados dinamicamente de um nó para outro conforme necessário para o desempenho sem nenhum tempo de inatividade (você pode controlar o quão agressivamente isso é feito).
Com o ESXi, você não pode usar o Virtual Center para gerenciar o host, portanto, você deve gerenciar cada host independentemente. Com 1 ou 2 hosts, isso não é tão ruim, mas à medida que você recebe mais hosts, torna-se difícil lembrar qual host é uma VM. Com o Virtual Center, você agrupa tudo em um datacenter e tudo é apresentado como um único pool de recursos.
Além do Virtual Center, há uma licença para o conversor VMware e a capacidade de criar modelos que tornam a criação de novas VMs um processo de 5 a 10 minutos para ativar uma nova VM do Windows com o sistema operacional já instalado.