Infelizmente, com a natureza modular dos manipuladores de extensão de diretiva de grupo, não acredito que você encontre uma ferramenta melhor do que o Console de Gerenciamento de Diretiva de Grupo para fazer o que procura.
Seu caminho mais fácil será usar um computador associado ao domínio para executar o GPMC e examinar / exportar os GPOs. Obviamente, se houver GPOs que tenham suas permissões padrão modificadas, talvez você não tenha acesso a eles com suas credenciais para auditá-las.
Dado o quão fácil seria fazer o que você deseja com o GPMC em um computador membro do domínio, eu diria que você deveria fazer isso. Se você tiver problemas, eu o consideraria um problema "político" / de gerenciamento e não um problema técnico. O GPMC é a ferramenta certa para o trabalho e, se você espera fazer o trabalho, precisa ter acesso para fazê-lo. O mesmo aconteceria com o acesso aos GPOs aos quais suas credenciais de domínio podem não ter acesso.
Se você absolutamente não puder obter acesso a um computador membro do domínio executando o GPMC, sua próxima melhor alternativa (mas indesejável) seria ter um administrador lá fazendo backup de todos os GPOs e dando o backup para você. Você pode importar esse backup para outro domínio do AD que você controla e audita os GPOs lá. O problema dessa estratégia é que todas as informações de SID no domínio original serão incompreensíveis para você em seu próprio domínio (e serão perdidas se você "mapear" os GPOs importados para usuários / grupos dentro de seu domínio).
GPMC é sua ferramenta. Descubra como fazer com que os "poderes que estão" lhe permitam usar a ferramenta e você realize o trabalho com rapidez e eficiência.