Respostas:
eu encontrei uma resposta .. eu poderia fazer um: start_program = "su -c 'comando aqui' USERiWANTtoUSE" .. :)
Qual sistema operacional / distribuição você está usando? Como você instalou o Monit? A maioria dos dsitros 'faz a coisa certa' e garante que as coisas não iniciem como raiz.
monit -c .monitrc