O clone vinculado funciona de maneira semelhante à técnica de instantâneo. Os instantâneos funcionam de uma maneira que economiza o uso do disco: quando você cria um instantâneo e faz alterações depois disso (à medida que trabalha com o sistema dentro da VM), o VMware armazena apenas as partes alteradas do disco (setores).
Os clones de VMs vinculados funcionam de maneira semelhante: se você possui um disco de 10 GB e cria um clone vinculado, não precisa de 10 GB de espaço adicional - apenas muito menos. Conforme você trabalha com a VM original ou clonada, apenas as alterações ou diferenças são armazenadas. É importante observar que a VM clonada ainda depende da imagem do disco original.
Mas: você pode trabalhar com as duas VMs independentemente - as diferenças são apenas internas. Você economiza espaço em disco ao usar um clone vinculado - mas o desempenho também pode ser menor em certos casos.
Se você tiver muitas VMs muito semelhantes para executar, pode fazer sentido usar clones vinculados, pois você pode economizar muito espaço em disco.
Se você apenas clonar uma VM e começar a instalar software ou dados totalmente diferentes, um clone copiado pode ser melhor.