ps aux |grep python |grep -v 'pattern_of_process_you_dont_want_to_kill' |awk '{print $2}' |xargs kill
Atualização: explicação passo a passo, conforme solicitado nos comentários
ps aux |grep python- mostra todos os processos que correspondem ao pythonpadrão
grep -v 'pattern_of_process_you_dont_want_to_kill' - excluir processo que você não quer matar
awk '{print $2}' - mostra o segundo campo de saída, é PID.
xargs kill- aplique o killcomando a cada entrada arg (PID).
Se você não estiver familiarizado com o xargscomando, aconselho que não se preocupe se não o entender imediatamente. Pode parecer bastante complicado pela primeira vez. Eu postei um exemplo muito simples de seu uso, você pode pesquisar no Google por mais.