Para posições de engenharia de software, a resposta provavelmente é sim na maioria dos casos. Isso pressupõe que eles realmente sabem a diferença. Os programas de CS normalmente carecem de qualquer tipo de cobertura relacionada ao design de soluções de software complexas. É quase como perguntar se um empregador prefere um diploma de física ou um engenheiro mecânico.
Edit: Eu realmente acho que as pessoas precisam reavaliar o que você acha que é uma boa resposta para esta pergunta. Eu acho que alguns deles são casos de canto e / ou não são práticos.
"Os empregadores preferem indivíduos que eles acham que podem fazer o trabalho com um alto padrão em um ambiente de ritmo acelerado"
Essa afirmação é verdadeira, mas você precisa entrar primeiro pela porta antes de poder ser avaliado. Baseado apenas no grau que você obteve e descobrindo qualquer experiência em estágios e no que não. Acredito firmemente que, na maioria dos casos, os empregadores verão primeiro o SE.
"Então, para responder à pergunta diretamente, eu não teria preferência entre os graus CS ou SE".
Suponha que você tenha 100 candidatos. Como você os filtraria para dizer 20? "conhecimento técnico, atitude, personalidade, motivação, etc." são boas qualidades, mas você não as determinará em um currículo. O tipo de diploma que você possui é definitivamente usado como filtro, especialmente se você tiver que enviar um currículo eletronicamente como parte do processo de inscrição. É fácil e rápido. É exatamente a mesma coisa que usar o GPA como filtro. Sim, você pode dizer que não importa, mas posso garantir que os 3.5s estão sendo vistos mais do que os 3.0s
Alguém observou que a maioria das pessoas não sabe a diferença entre os dois. Provavelmente isso é verdade, mas muitos o fazem e, se você tiver um diploma de ensino médio, ele aumenta o seu expositor para aqueles que não sabem e para quem sabe.
Por fim, se você quer ser um desenvolvedor, um diploma de SE abrirá mais portas para você. Não estou dizendo que o CS seja restritivo de forma alguma ou que um seja melhor que o outro. O que estou dizendo é que um diploma de SE será mais comercializável em geral em termos de encontrar uma posição de engenheiro de software. Sempre há exceções.