Na minha opinião, as bibliotecas javascript, primeiramente o Jquery são projetadas como uma ferramenta para aprimorar a aparência do site, além de adicionar funções mais fáceis de passagem de DOM e chamada de AJAX.
E como ferramenta, ele é excelente em seu domínio, mas agora o Javascript emergiu como a principal linguagem de programação para tarefas específicas do HTML5, principalmente a tela.
Inclui trabalhadores da web / armazenamento e etc.
HTML5
Portanto, se você planeja desenvolver aplicativos / RIAs complexos, precisará eliminar a sobrecarga geralmente usada na generalização de funções da biblioteca.
E você precisará desenvolver aplicativos mais rápidos e com menor consumo de memória / processador, que serão executados em uma ampla variedade de computadores clientes.
Portanto, se você não planeja divulgar a criação de aplicativos javascript complexos, não terá problemas em continuar usando o Jquery sem familiaridade prévia com javascript.
"Meu mentor sempre dizia" não se apaixone por uma biblioteca (aplicativo, depende do contexto), aprenda a fazer você mesmo, porque há algo que ele não pode fazer e então você está de volta aonde começou! "