Provavelmente é em grande parte histórico.
A maioria dos aplicativos para a maioria dos telefones foi distribuída principalmente por operadoras por um bom tempo, e eles monetizaram praticamente tudo desde o primeiro dia. Até a maioria dos toques custa dinheiro (geralmente duas vezes mais - pague uma vez pelo toque adequado e novamente pelo download).
Por outro lado, desde que a Microsoft decidiu começar a distribuir cópias do IE, todos os navegadores nos PCs eram livres e (para ser honesto), a maioria trabalhava duro para manter a participação de mercado, mesmo sendo livre. Extensões foram vistas por muitos como uma forma de "vender" o próprio navegador e foram amplamente distribuídas para ajudar a ganhar participação de mercado no (s) navegador (s) preferido (s) do desenvolvedor.
Isso leva a muita inércia também. Dado o grande (grande?) Número de extensões realmente boas que já são gratuitas, suspeito que o número de usuários que considerariam pagar por extensões seja bem pequeno. O campo já está bastante cheio, então você precisa fazer algo bastante espetacular para justificar qualquer preço mais alto.
Acredito que a loja de aplicativos do Google (por exemplo) já suporta um modelo de pagamento pelo menos em teoria; dado o número e a qualidade das extensões gratuitas, no entanto, é difícil imaginar uma extensão conquistando muitos clientes a um preço mais alto.