Em um recente MeetUp de UI / UX que participei, dei alguns comentários em um site que usava Javascript (jQuery) para sua interação e interface do usuário - eram animações e manipulação bastante simples, mas o desempenho em um computador decente era horrível.
Na verdade, ele me lembrou muitos sites / programas que eu já vi com o mesmo problema, onde certas ações simplesmente destroem o desempenho. É principalmente em (ou pelo menos mais perceptível em) situações em que o Javascript está quase servindo como um substituto do Flash. Isso contrasta fortemente com alguns dos aplicativos da web que eu usei, que possuem muito mais Javascript e funcionalidade, mas funcionam muito bem (o COGNOS da IBM é um dos que eu consigo pensar).
Eu adoraria conhecer alguns dos problemas comuns que não são considerados no desenvolvimento de JS que prejudicam o desempenho do site.