Não é possível fazer com que esta rede de autoencoder funcione corretamente (com camadas convolutional e maxpool)

9

As redes de codificadores automáticos parecem ser muito mais complicadas do que as redes MLP classificadoras normais. Depois de várias tentativas usando Lasagne, tudo o que recebo na saída reconstruída é algo que se assemelha, na melhor das hipóteses, a uma média borrada de todas as imagens do banco de dados MNIST, sem distinção do que realmente é o dígito de entrada.

A estrutura de redes que escolhi são as seguintes camadas em cascata:

  1. camada de entrada (28x28)
  2. Camada convolucional 2D, tamanho do filtro 7x7
  3. Camada de pool máximo, tamanho 3x3, passada 2x2
  4. Camada achatada densa (totalmente conectada), 10 unidades (este é o gargalo)
  5. Camada densa (totalmente conectada), 121 unidades
  6. Remodelando a camada para 11x11
  7. Camada convolucional 2D, tamanho do filtro 3x3
  8. Fator 2 da camada de upscaling 2D
  9. Camada convolucional 2D, tamanho do filtro 3x3
  10. Fator 2 da camada de upscaling 2D
  11. Camada convolucional 2D, tamanho do filtro 5x5
  12. Pool máximo de recursos (de 31x28x28 a 28x28)

Todas as camadas convolucionais 2D têm os vieses desatados, ativações sigmóides e 31 filtros.

Todas as camadas totalmente conectadas possuem ativações sigmóides.

A função de perda usada é um erro ao quadrado , a função de atualização é adagrad. O comprimento do pedaço para o aprendizado é de 100 amostras, multiplicadas por 1000 épocas.

A seguir, é apresentada uma ilustração do problema: na linha superior estão algumas amostras definidas como entradas da rede, a linha inferior é a reconstrução:

entrada e saída do autoencoder

Apenas para completar, a seguir está o código que usei:

import theano.tensor as T
import theano
import sys
sys.path.insert(0,'./Lasagne') # local checkout of Lasagne
import lasagne
from theano import pp
from theano import function
import gzip
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
import matplotlib.pyplot as plt
def load_mnist():

    def load_mnist_images(filename):
        with gzip.open(filename, 'rb') as f:
            data = np.frombuffer(f.read(), np.uint8, offset=16)
        # The inputs are vectors now, we reshape them to monochrome 2D images,
        # following the shape convention: (examples, channels, rows, columns)
        data = data.reshape(-1, 1, 28, 28)
        # The inputs come as bytes, we convert them to float32 in range [0,1].
        # (Actually to range [0, 255/256], for compatibility to the version
        # provided at http://deeplearning.net/data/mnist/mnist.pkl.gz.)
        return data / np.float32(256)

    def load_mnist_labels(filename):
        # Read the labels in Yann LeCun's binary format.
        with gzip.open(filename, 'rb') as f:
            data = np.frombuffer(f.read(), np.uint8, offset=8)
        # The labels are vectors of integers now, that's exactly what we want.
        return data

    X_train = load_mnist_images('train-images-idx3-ubyte.gz')
    y_train = load_mnist_labels('train-labels-idx1-ubyte.gz')
    X_test = load_mnist_images('t10k-images-idx3-ubyte.gz')
    y_test = load_mnist_labels('t10k-labels-idx1-ubyte.gz')
    return X_train, y_train, X_test, y_test

def plot_filters(conv_layer):
    W = conv_layer.get_params()[0]
    W_fn = theano.function([],W)
    params = W_fn()
    ks = np.squeeze(params)
    kstack = np.vstack(ks)
    plt.imshow(kstack,interpolation='none')
    plt.show()

def main():

    #theano.config.exception_verbosity="high"
    #theano.config.optimizer='None'

    X_train, y_train, X_test, y_test = load_mnist()
    ohe = OneHotEncoder()

    y_train = ohe.fit_transform(np.expand_dims(y_train,1)).toarray()
    chunk_len = 100
    visamount = 10
    num_epochs = 1000
    num_filters=31
    dropout_p=.0
    print "X_train.shape",X_train.shape,"y_train.shape",y_train.shape
    input_var = T.tensor4('X')
    output_var = T.tensor4('X')
    conv_nonlinearity = lasagne.nonlinearities.sigmoid
    net = lasagne.layers.InputLayer((chunk_len,1,28,28), input_var)
    conv1 = net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(7,7),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(net,(3,3),stride=(2,2))
    net = lasagne.layers.DropoutLayer(net,p=dropout_p)
    #conv2_layer = lasagne.layers.Conv2DLayer(dropout_layer,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity)
    #pool2_layer = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(conv2_layer,(3,3),stride=(2,2))
    net = lasagne.layers.DenseLayer(net,10,nonlinearity=lasagne.nonlinearities.sigmoid)

    #augment_layer1 = lasagne.layers.DenseLayer(reduction_layer,33,nonlinearity=lasagne.nonlinearities.sigmoid)
    net = lasagne.layers.DenseLayer(net,121,nonlinearity=lasagne.nonlinearities.sigmoid)

    net = lasagne.layers.ReshapeLayer(net,(chunk_len,1,11,11))

    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.Upscale2DLayer(net,2)

    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    #pool_after0 = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(conv_after1,(3,3),stride=(2,2))
    net = lasagne.layers.Upscale2DLayer(net,2)

    net = lasagne.layers.DropoutLayer(net,p=dropout_p)

    #conv_after2 = lasagne.layers.Conv2DLayer(upscale_layer1,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    #pool_after1 = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(conv_after2,(3,3),stride=(1,1))
    #upscale_layer2 = lasagne.layers.Upscale2DLayer(pool_after1,4)

    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(5,5),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.FeaturePoolLayer(net,num_filters,pool_function=theano.tensor.max)
    print "output_shape:",lasagne.layers.get_output_shape(net)
    params = lasagne.layers.get_all_params(net, trainable=True)
    prediction = lasagne.layers.get_output(net)
    loss = lasagne.objectives.squared_error(prediction, output_var)
    #loss = lasagne.objectives.binary_crossentropy(prediction, output_var)
    aggregated_loss = lasagne.objectives.aggregate(loss)
    updates = lasagne.updates.adagrad(aggregated_loss,params)
    train_fn = theano.function([input_var, output_var], loss, updates=updates)

    test_prediction = lasagne.layers.get_output(net, deterministic=True)
    predict_fn = theano.function([input_var], test_prediction)

    print "starting training..."
    for epoch in range(num_epochs):
        selected = list(set(np.random.random_integers(0,59999,chunk_len*4)))[:chunk_len]
        X_train_sub = X_train[selected,:]
        _loss = train_fn(X_train_sub, X_train_sub)
        print("Epoch %d: Loss %g" % (epoch + 1, np.sum(_loss) / len(X_train)))
        """
        chunk = X_train[0:chunk_len,:,:,:]
        result = predict_fn(chunk)
        vis1 = np.hstack([chunk[j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        vis2 = np.hstack([result[j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        plt.imshow(np.vstack([vis1,vis2]))
        plt.show()
        """
    print "done."

    chunk = X_train[0:chunk_len,:,:,:]
    result = predict_fn(chunk)
    print "chunk.shape",chunk.shape
    print "result.shape",result.shape
    plot_filters(conv1)
    for i in range(chunk_len/visamount):
        vis1 = np.hstack([chunk[i*visamount+j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        vis2 = np.hstack([result[i*visamount+j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        plt.imshow(np.vstack([vis1,vis2]))
        plt.show()
    import ipdb; ipdb.set_trace()

if __name__ == "__main__":
    main()

Alguma idéia de como melhorar essa rede para obter um autoencoder razoavelmente funcional?

Problema resolvido!

Com uma implementação bastante diferente, usando um retificador com vazamento em vez de uma função sigmóide nas camadas convolucionais, apenas 2 (!!) nós na camada de gargalo e convoluções com kernels 1x1 no final.

Aqui está o resultado de alguma reconstrução:

insira a descrição da imagem aqui

Código:

import theano.tensor as T
import theano
import sys
sys.path.insert(0,'./Lasagne') # local checkout of Lasagne
import lasagne
from theano import pp
from theano import function
import theano.tensor.nnet
import gzip
import numpy as np
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
import matplotlib.pyplot as plt
def load_mnist():

    def load_mnist_images(filename):
        with gzip.open(filename, 'rb') as f:
            data = np.frombuffer(f.read(), np.uint8, offset=16)
        # The inputs are vectors now, we reshape them to monochrome 2D images,
        # following the shape convention: (examples, channels, rows, columns)
        data = data.reshape(-1, 1, 28, 28)
        # The inputs come as bytes, we convert them to float32 in range [0,1].
        # (Actually to range [0, 255/256], for compatibility to the version
        # provided at http://deeplearning.net/data/mnist/mnist.pkl.gz.)
        return data / np.float32(256)

    def load_mnist_labels(filename):
        # Read the labels in Yann LeCun's binary format.
        with gzip.open(filename, 'rb') as f:
            data = np.frombuffer(f.read(), np.uint8, offset=8)
        # The labels are vectors of integers now, that's exactly what we want.
        return data

    X_train = load_mnist_images('train-images-idx3-ubyte.gz')
    y_train = load_mnist_labels('train-labels-idx1-ubyte.gz')
    X_test = load_mnist_images('t10k-images-idx3-ubyte.gz')
    y_test = load_mnist_labels('t10k-labels-idx1-ubyte.gz')
    return X_train, y_train, X_test, y_test

def main():

    X_train, y_train, X_test, y_test = load_mnist()
    ohe = OneHotEncoder()

    y_train = ohe.fit_transform(np.expand_dims(y_train,1)).toarray()
    chunk_len = 100
    num_epochs = 10000
    num_filters=7
    input_var = T.tensor4('X')
    output_var = T.tensor4('X')
    #conv_nonlinearity = lasagne.nonlinearities.sigmoid
    #conv_nonlinearity = lasagne.nonlinearities.rectify
    conv_nonlinearity = lasagne.nonlinearities.LeakyRectify(.1)
    softplus = theano.tensor.nnet.softplus
    #conv_nonlinearity = theano.tensor.nnet.softplus
    net = lasagne.layers.InputLayer((chunk_len,1,28,28), input_var)
    conv1 = net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(7,7),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(net,(3,3),stride=(2,2))
    net = lasagne.layers.DenseLayer(net,2,nonlinearity=lasagne.nonlinearities.sigmoid)
    net = lasagne.layers.DenseLayer(net,49,nonlinearity=lasagne.nonlinearities.sigmoid)
    net = lasagne.layers.ReshapeLayer(net,(chunk_len,1,7,7))
    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(net,(3,3),stride=(1,1))
    net = lasagne.layers.Upscale2DLayer(net,4)
    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(3,3),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.MaxPool2DLayer(net,(3,3),stride=(1,1))
    net = lasagne.layers.Upscale2DLayer(net,4)
    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(5,5),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,num_filters,(1,1),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    net = lasagne.layers.FeaturePoolLayer(net,num_filters,pool_function=theano.tensor.max)
    net = lasagne.layers.Conv2DLayer(net,1,(1,1),nonlinearity=conv_nonlinearity,untie_biases=True)
    print "output shape:",net.output_shape
    params = lasagne.layers.get_all_params(net, trainable=True)
    prediction = lasagne.layers.get_output(net)
    loss = lasagne.objectives.squared_error(prediction, output_var)
    #loss = lasagne.objectives.binary_hinge_loss(prediction, output_var)
    aggregated_loss = lasagne.objectives.aggregate(loss)
    #updates = lasagne.updates.adagrad(aggregated_loss,params)
    updates = lasagne.updates.nesterov_momentum(aggregated_loss,params,0.5)#.005
    train_fn = theano.function([input_var, output_var], loss, updates=updates)

    test_prediction = lasagne.layers.get_output(net, deterministic=True)
    predict_fn = theano.function([input_var], test_prediction)

    print "starting training..."
    for epoch in range(num_epochs):
        selected = list(set(np.random.random_integers(0,59999,chunk_len*4)))[:chunk_len]
        X_train_sub = X_train[selected,:]
        _loss = train_fn(X_train_sub, X_train_sub)
        print("Epoch %d: Loss %g" % (epoch + 1, np.sum(_loss) / len(X_train)))
    print "done."

    chunk = X_train[0:chunk_len,:,:,:]
    result = predict_fn(chunk)
    print "chunk.shape",chunk.shape
    print "result.shape",result.shape
    visamount = 10
    for i in range(10):
        vis1 = np.hstack([chunk[i*visamount+j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        vis2 = np.hstack([result[i*visamount+j,0,:,:] for j in range(visamount)])
        plt.imshow(np.vstack([vis1,vis2]))
        plt.show()

    import ipdb; ipdb.set_trace()
if __name__ == "__main__":
    main()
machine-learning  neural-networks  dimensionality-reduction  unsupervised-learning  autoencoders 
— fstab
fonte

Respostas:

4

Você pode obter mais informações visualizando os pesos em vez de apenas as reconstruções. Eu tive um problema semelhante quando meus preconceitos foram mal configurados. Tudo abaixo é escrito com base em minhas experiências escrevendo minha própria biblioteca de aprendizado. Você pode ver o código aqui no Github http://github.com/josephcatrambone/aij .

Aqui está uma captura de tela do meu programa quando não há preconceitos. Isso ocorre depois de apenas dez épocas, já que estou com pressa de terminar este artigo:

Apenas pesos - sem viés.

A atualização de peso é feita por estas operações: 

weights.add_i(positiveProduct.subtract(negativeProduct).elementMultiply(learningRate / (float) batchSize));
//visibleBias.add_i(batch.subtract(negativeVisibleProbabilities).meanRow().elementMultiply(learningRate));
//hiddenBias.add_i(positiveHiddenProbabilities.subtract(negativeHiddenProbabilities).meanRow().elementMultiply(learningRate));

Se eu descomentar o código de viés visível, obtenho este resultado:

Corrija o viés visível.

Se eu estragar o sinal do código de viés visível (subtrair em vez de adicionar):

visibleBias.subtract_i(batch.subtract(negativeVisibleProbabilities).meanRow().elementMultiply(learningRate));

Eu recebo esta imagem:

Sinal de viés invertido.

Que bolas de neve e, eventualmente, atinge algo parecido com o que você tem acima. Verifique a sinalização das suas funções de erro.

— Joseph Catrambone
fonte
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