Eu não estou totalmente certo o modelo real "medidas repetidas ANOVA" descreve, mas acho que uma questão geral é se colocar efeitos aleatórios de qualquer tipo em um modelo em vez de por exemplo, basta ajustar as estimativas de variância para cobrir as dependências induzidas (como no Os erros padrão corrigidos pelo painel e os modelos multiníveis debatem na análise de dados transversais de séries temporais). Então, vou tentar essa pergunta primeiro e depois abordar a sua.
Efeitos fixos e aleatórios
Dois princípios complementares sobre quando usar um efeito aleatório em vez de fixo são os seguintes:
- Represente uma coisa (sujeito, tipo de estímulo etc.) com um efeito aleatório quando estiver interessado em usar o modelo para generalizar para outras instâncias dessa coisa não incluídas na análise atual, por exemplo, outro sujeito ou outro tipo de estímulo. Caso contrário, use um efeito fixo.
- Represente uma coisa com efeito aleatório quando você acha que, para qualquer instância, outras instâncias no conjunto de dados são potencialmente informativas. Se você não espera essa informação, use um efeito fixo.
Ambos motivam explicitamente a inclusão de efeitos aleatórios do sujeito: geralmente você está interessado nas populações humanas em geral e os elementos do conjunto de respostas de cada sujeito são correlacionados, previsíveis um do outro e, portanto, informativos um sobre o outro. É menos claro para coisas como estímulos. Se houver apenas três tipos de estímulos, 1. motivará um efeito fixo e 2. tomará a decisão dependente da natureza dos estímulos.
Suas perguntas
Uma razão para usar um modelo misto em detrimento de efeitos repetidos ANOVA é que os primeiros são consideravelmente mais gerais, por exemplo, funcionam igualmente facilmente com projetos balanceados e desbalanceados e são facilmente estendidos a modelos multiníveis. Na minha leitura (reconhecidamente limitada) sobre a ANOVA clássica e suas extensões, os modelos mistos parecem cobrir todos os casos especiais que as extensões da ANOVA. Então, na verdade, não consigo pensar em uma razão estatística para preferir medidas repetidas ANOVA. Outros podem ajudar aqui. (Uma razão sociológica familiar é que o seu campo prefere ler sobre os métodos que os membros mais velhos aprenderam na escola de pós-graduação, e uma razão prática é que pode demorar um pouco mais para aprender a usar modelos mistos do que uma pequena extensão da ANOVA.)
Nota
Uma ressalva para o uso de efeitos aleatórios, mais relevante para dados não- experimentais, é que, para manter a consistência, você deve assumir que os efeitos aleatórios não estão correlacionados com os efeitos fixos do modelo ou adicionar meios de efeito fixo como covariáveis para o efeito aleatório (discutido por exemplo, no artigo de Bafumi e Gelman).