Uma resposta rápida ao conteúdo com marcadores:
1) Erro de potência / tipo 1 em uma análise bayesiana vs. uma análise freqüentista
Perguntar sobre o Tipo 1 e a potência (isto é, um menos a probabilidade de erro do Tipo 2) implica que você pode colocar seu problema de inferência em uma estrutura de amostragem repetida. Você pode? Se você não pode, não há muita escolha a não ser afastar-se das ferramentas de inferência freqüente. Se você puder, e se o comportamento do seu estimador em muitas dessas amostras for relevante, e se você não estiver particularmente interessado em fazer declarações de probabilidade sobre eventos específicos, não há motivos fortes para mudar.
O argumento aqui não é que tais situações nunca surjam - certamente elas surgem - mas que elas normalmente não surgem nos campos em que os métodos são aplicados.
2) O trade-off na complexidade da análise (Bayesiano parece mais complicado) versus os benefícios obtidos.
É importante perguntar para onde vai a complexidade. Em procedimentos freqüentistas, a implementação pode ser muito simples, por exemplo, minimizar a soma dos quadrados, mas os princípios podem ser arbitrariamente complexos, geralmente girando em torno de qual estimador (es) escolher, como encontrar o (s) teste (s) certo (s), o que pensar quando eles discordam. Por exemplo. veja a discussão ainda animada, apresentada neste fórum, de diferentes intervalos de confiança para uma proporção!
Nos procedimentos bayesianos, a implementação pode ser arbitrariamente complexa, mesmo em modelos que parecem "simples", geralmente por causa de integrais difíceis, mas os princípios são extremamente simples. Depende bastante de onde você gostaria que a bagunça estivesse.
3) As análises estatísticas tradicionais são diretas, com diretrizes bem estabelecidas para tirar conclusões.
Pessoalmente, não me lembro mais, mas certamente meus alunos nunca as acharam simples, principalmente devido ao princípio da proliferação descrito acima. Mas a questão não é realmente se um procedimento é direto, mas se está mais perto de estar certo, dada a estrutura do problema.
Por fim, discordo totalmente de que existem "diretrizes bem estabelecidas para tirar conclusões" em ambos os paradigmas. E acho que é uma coisa boa . Claro, "encontrar p <0,05" é uma diretriz clara, mas para qual modelo, com quais correções etc.? E o que faço quando meus testes discordam? O julgamento científico ou de engenharia é necessário aqui, como em outros lugares.