Respostas:
Dependendo dos usos pretendidos para a estação de trabalho.
De acordo com a folha de especificações do 4700, o compartimento ODD é SATA2 max, portanto, colocando o SSD, na verdade, há um desperdício de largura de banda. Mas, como você já está montando um SSD mSATA, não sentirá nenhuma diferença, pois o mSATA no 4700 também é apenas SATA2.
Minha recomendação seria colocar um SSD na baia do disco rígido e usá-lo no sistema operacional, e o resto da maneira que você quiser.
Provavelmente, isso não importa em nada no M4700, pois o sistema foi projetado especificamente em torno da suposição de que alguém pode querer colocar um HD no lugar do DVD. (Em alguns outros sistemas, pode fazer sentido colocar o HDD no compartimento do CD porque ele pode ter um barramento mais lento; por outro lado, pode fazer sentido trocá-lo se o compartimento do drive estiver localizado mais centralmente no computador para reduzir o risco de danos - mas como está no limite do M4700, duvido que faça diferença)