Por que um diretório copiado com o comando cp é menor que o original?

Estou tentando copiar um diretório com um grande número de arquivos para outro destino. Eu fiz:

cp -r src_dir another_destination/

Então eu queria confirmar que o tamanho do diretório de destino é o mesmo que o original:

du -s src_dir
3782288 src_dir

du -s another_destination/src_dir
3502320 another_destination/src_dir

Pensei que houvesse vários links simbólicos que não fossem seguidos pelo cpcomando e adicionei a -aflag:

-a Mesmo que as opções -pPR. Preserva a estrutura e os atributos dos arquivos, mas não a estrutura de diretórios.

cp -a src_dir another_destination/

mas du -sme deu os mesmos resultados. É interessante que a origem e o destino tenham o mesmo número de arquivos e diretórios:

tree src_dir | wc -l
    4293

tree another_destination/src_dir | wc -l
    4293

O que estou fazendo de errado em obter tamanhos diferentes com o ducomando?

ATUALIZAR

Quando tento obter tamanhos de diretórios individuais com o ducomando, obtenho resultados diferentes:

du -s src_dir/sub_dir1
1112    src_dir/sub_dir1

du -s another_destination/src_dir/sub_dir1
1168    another_destination/src_dir/sub_dir1

Quando visualizo arquivos com ls -la, os tamanhos de arquivos individuais são os mesmos, mas os totais são diferentes:

ls -la src_dir/sub_dir1
total 1168
drwxr-xr-x     5 hirurg103  staff     160 Jan 30 20:58 .
drwxr-xr-x  1109 hirurg103  staff   35488 Jan 30 21:43 ..
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff  431953 Jan 30 20:58 file1.pdf
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff  126667 Jan 30 20:54 file2.png
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff    7386 Jan 30 20:49 file3.png

ls -la another_destination/src_dir/sub_dir1
total 1112
drwxr-xr-x     5 hirurg103  staff     160 Jan 30 20:58 .
drwxr-xr-x  1109 hirurg103  staff   35488 Jan 30 21:43 ..
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff  431953 Jan 30 20:58 file1.pdf
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff  126667 Jan 30 20:54 file2.png
-rw-r--r--     1 hirurg103  staff    7386 Jan 30 20:49 file3.png

Isso ocorre porque, dupor padrão, mostra não o tamanho do (s) arquivo (s), mas o espaço em disco que eles estão usando. Você precisa usar a -bopção para obter a soma dos tamanhos dos arquivos, em vez do total do espaço em disco usado. Por exemplo:

% printf test123 > a
% ls -l a
-rw-r--r-- 1 mnalis mnalis 7 Feb  1 19:57 a
% du -h a
4,0K    a
% du -hb a
7       a

Mesmo que o arquivo tenha apenas 7 bytes de comprimento, ele ocupará um total de 4096 bytes de espaço em disco (no meu exemplo particular; variará dependendo do sistema de arquivos usado, do tamanho do cluster etc.).

Além disso, alguns sistemas de arquivos oferecem suporte aos chamados arquivos esparsos, que não usam espaço em disco para blocos que são todos zeros. Por exemplo:

% dd if=/dev/zero of=regular.bin bs=4k count=10
10+0 records in
10+0 records out
40960 bytes (41 kB, 40 KiB) copied, 0,000131003 s, 313 MB/s
% cp --sparse=always regular.bin sparse.bin
% ls -l *.bin
-rw-r--r-- 1 mnalis mnalis 40960 Feb  1 20:04 regular.bin
-rw-r--r-- 1 mnalis mnalis 40960 Feb  1 20:04 sparse.bin
% du -h *.bin
40K     regular.bin
0       sparse.bin
% du -hb *.bin
40960   regular.bin
40960   sparse.bin

Em resumo, para verificar se todos os arquivos foram copiados, você usaria em du -sbvez de du -s.

Pode ser devido ao tamanho do diretório "arquivos".

Na maioria dos sistemas de arquivos, em disco, um diretório é muito parecido com um arquivo comum (com apenas uma lista de nomes e números de nós, principalmente), usando mais blocos à medida que cresce.

Se você adicionar muitos arquivos, o próprio diretório aumentará. Mas se você os remover posteriormente, em muitos sistemas de arquivos, o diretório não diminuirá.

Portanto, se um dos diretórios da sua árvore original tiver muitos arquivos em algum momento, que foram posteriormente excluídos, a cópia desse diretório será "menor", pois usa apenas quantos blocos forem necessários para o número atual de arquivos.

Nas listagens da sua atualização, existem 3 diretórios que você não listou. Compare o tamanho desses (ou descendentes deles) em sua ls -alsaída.

Para descobrir onde está a diferença, tente um ls -alrnos dois diretórios, redirecionado para um arquivo e, em seguida, uma diffdas duas saídas.