Os && são analisados pelo seu shell original. Colocar um sudo na frente afeta apenas a configuração. A última opção faz mais sentido, porque irá configurar e compilar como um usuário comum e, em seguida, instalar os resultados para que todos possam usar.
Uma ressalva é que alguns scripts de configuração detectam que eles estão sendo executados como usuários não-root e criam makefiles que são instalados no $ HOME ou similar. Nesse caso, você deseja 'sudo ./configure' também. Se você executar o configure ou make como root, terá o aborrecimento de alguns arquivos pertencentes à raiz em seu diretório de usuários regulares.