Use o Process Explorer do Sysinternal . Como o gerenciador de tarefas, este aplicativo pode mostrar todos os processos em execução.
Mas também pode mostrar os argumentos da linha de comando usados para iniciar o processo: clique com o botão direito do mouse nos cabeçalhos da coluna e selecione a coluna "linha de comando". Essas informações extras ajudarão a identificar qual aplicativo java está sendo executado em um determinado java.exe
processo.
Se ainda não houver informações suficientes, o Process Explorer também poderá informar quais arquivos, conexões de rede, entradas do registro etc. estão sendo utilizados pelo processo.
atualização : conforme mencionado nos comentários abaixo, o Gerenciador de tarefas padrão do Windows também pode mostrar a linha de comando. Vá em "Visualizar" - "Selecionar colunas ..." e marque "Linha de comando".