No linux, geralmente evita que você (ou um aplicativo agindo em seu nome) acidentalmente faça algo idiota.
No Windows, você não pode instalar muitos tipos de software sem executar uma conta como administrador, porque não possui acesso de gravação aos arquivos do programa ou às pastas do Windows. Os piores tipos de malware precisam ser capazes de gravar nessas áreas para invadir seu sistema.
Se você não estiver executando como administrador e visitar um site comprometido que tentar instalar algo como um keylogger oculto para roubar senhas, informações bancárias ou números de cartão de crédito, essa instalação provavelmente falhará. Se você estiver executando como administrador, essa instalação terá uma chance muito maior de êxito. O mesmo princípio se aplica aos sistemas Linux.
A chave aqui é que o software antivírus nem entra em ação. Atualmente, o software antivírus é sua última linha de defesa, não a sua primeira. A ordem de importância que eu uso para avaliar as medidas de segurança é assim:
- Mantenha seu sistema (incluindo software aplicativo) atualizado
- Não execute como administrador
- Use outros hábitos seguros da Internet
- Executar um firewall
- Tenha um bom backup offline (nesse caso, offline significa "não acessível ao seu sistema de arquivos normal", o que pode realmente significar o uso de um serviço online)
- Execute o software antivírus
De fato, se você estiver executando o suficiente dos outros itens corretamente, o software antivírus não será realmente necessário. Mas o importante aqui é que executar como administrador é um não-não.
Felizmente, agora é o estado padrão no Windows 7. Mesmo que sua conta tenha privilégios de administrador, ela ainda será executada em "área restrita" e apenas lhe dará o direito de elevar para um aplicativo específico sob demanda.