Existem cálculos de soma de verificação aqui e ali ao copiar arquivos (pacotes IP possuem somas de verificação, certos dispositivos de bloco como CDs ou DVDs possuem ECC), mas não há realmente nada que forneça proteção de ponta a ponta. Mesmo o ZFS (que possui verificação CRC embutida) é propenso a falhas quando o sistema lê os dados corretos e depois grava os dados errados (erro de software, erro de bit de cache, etc.). Certa vez, tive um disco rígido com dois bits ruins na RAM, causando problemas de corrupção de dados muito raros, mas muito desagradáveis. Você está fazendo um favor a si mesmo se mantiver um banco de dados de soma de verificação (ou melhor, CRC ou hash) para arquivos que pretende manter por um longo tempo.