Acho difícil acreditar que os arquitetos de rede de uma universidade se deixariam vulneráveis a uma falha TOTAL da rede, no caso de um aluno conectar um roteador no soquete do dormitório. A chance de um aluno tentar isso é bastante alta (veja este post, por exemplo).
A resposta nítida do Occam é que o cara do suporte técnico provavelmente estava apenas tentando assustá-lo, em vez de dizer que ele simplesmente não sabia.
Além disso, em uma arquitetura ponto a ponto (ao contrário, digamos, do SNA, em que você pode destruir toda a rede fingindo ser o NCP), a probabilidade de algo como um conflito de dispositivo causar uma falha completa da rede é bastante baixa. PODERIA ser que seu roteador recebesse (ou você mesmo o definisse) o mesmo endereço IP de um dos hubs de distribuição do próprio edifício do dormitório, mas também PODERIA ser que um asteróide atingisse seu prédio.
Mas vamos supor que isso aconteça: contanto que o roteador Cisco não seja reinicializado, nada acontece, e seu roteador apenas reclama que não pode obter uma conexão adequada. Além disso, o roteador Cisco provavelmente reportaria a colisão de IP duplicada em um log em algum lugar (que operadores ou administradores de rede notariam).